RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442312.6

SH3BP2-203, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.11□□□□□ -1.27
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP10-1P60331 282 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2-203ENST00000442312 PP632Q6XCG6 107 aa7.1□□□□□ -1.27
SH3BP2-203ENST00000442312 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2-203ENST00000442312 A8MU10 97 aa7.09□□□□□ -1.27
SH3BP2-203ENST00000442312 LAMA3Q16787 3333 aa7.09□□□□□ -1.28
SH3BP2-203ENST00000442312 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.08□□□□□ -1.28
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.07□□□□□ -1.28
SH3BP2-203ENST00000442312 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
SH3BP2-203ENST00000442312 FBN2P35556 2912 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP10-2P60368 255 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP2-203ENST00000442312 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.06□□□□□ -1.28
SH3BP2-203ENST00000442312 LAMA1P25391 3075 aa7.04□□□□□ -1.28
SH3BP2-203ENST00000442312 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP2-203ENST00000442312 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7□□□□□ -1.29
SH3BP2-203ENST00000442312 TENM4Q6N022 2769 aa6.99□□□□□ -1.29
SH3BP2-203ENST00000442312 BRCA2P51587 3418 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP2-203ENST00000442312 ATMQ13315 3056 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP2-203ENST00000442312 TNP1P09430 55 aa6.97□□□□□ -1.29
SH3BP2-203ENST00000442312 USP34Q70CQ2 3546 aa6.96□□□□□ -1.29
SH3BP2-203ENST00000442312 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.29
SH3BP2-203ENST00000442312 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.96□□□□□ -1.29
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP2-203ENST00000442312 REV3LO60673 3130 aa6.95□□□□□ -1.3
SH3BP2-203ENST00000442312 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.92□□□□□ -1.3
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP2-203ENST00000442312 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.91□□□□□ -1.3
SH3BP2-203ENST00000442312 UNC80Q8N2C7 3258 aa6.9□□□□□ -1.3
SH3BP2-203ENST00000442312 COL6A3P12111 3177 aa6.9□□□□□ -1.31
SH3BP2-203ENST00000442312 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.87□□□□□ -1.31
SH3BP2-203ENST00000442312 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SH3BP2-203ENST00000442312 VWFP04275 2813 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP2-203ENST00000442312 H0YAA0 97 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP2-203ENST00000442312 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP2-203ENST00000442312 P0C880 135 aa6.83□□□□□ -1.32
SH3BP2-203ENST00000442312 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.78□□□□□ -1.32
SH3BP2-203ENST00000442312 VCANP13611 3396 aa6.77□□□□□ -1.33
SH3BP2-203ENST00000442312 CDH23Q9H251 3354 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP2-203ENST00000442312 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.76□□□□□ -1.33
SH3BP2-203ENST00000442312 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP2-203ENST00000442312 TENM2Q9NT68 2774 aa6.6□□□□□ -1.35
SH3BP2-203ENST00000442312 XP32Q5T750 250 aa6.57□□□□□ -1.36
SH3BP2-203ENST00000442312 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.55□□□□□ -1.36
SH3BP2-203ENST00000442312 COL7A1Q02388 2944 aa6.53□□□□□ -1.36
SH3BP2-203ENST00000442312 TPRXLQ17RH7 258 aa6.51□□□□□ -1.37
SH3BP2-203ENST00000442312 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP2-203ENST00000442312 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP10-8P60410 259 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.48□□□□□ -1.37
SH3BP2-203ENST00000442312 SZT2Q5T011 3432 aa6.46□□□□□ -1.38
SH3BP2-203ENST00000442312 EYSQ5T1H1 3165 aa6.45□□□□□ -1.38
SH3BP2-203ENST00000442312 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
SH3BP2-203ENST00000442312 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.41□□□□□ -1.38
SH3BP2-203ENST00000442312 SPEGQ15772 3267 aa6.39□□□□□ -1.39
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.35□□□□□ -1.39
SH3BP2-203ENST00000442312 FBN3Q75N90 2809 aa6.33□□□□□ -1.4
SH3BP2-203ENST00000442312 ZFHX3Q15911 3703 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP2-203ENST00000442312 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.32□□□□□ -1.4
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.31□□□□□ -1.4
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP12-2P59991 146 aa6.3□□□□□ -1.4
SH3BP2-203ENST00000442312 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.27□□□□□ -1.41
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP12-1P59990 96 aa6.2□□□□□ -1.42
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP10-10P60014 251 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP2-203ENST00000442312 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.18□□□□□ -1.42
SH3BP2-203ENST00000442312 INE1O15225 51 aa6.17□□□□□ -1.42
SH3BP2-203ENST00000442312 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.16□□□□□ -1.42
SH3BP2-203ENST00000442312 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP2-203ENST00000442312 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
SH3BP2-203ENST00000442312 A0A1B0GVY2 172 aa6.13□□□□□ -1.43
SH3BP2-203ENST00000442312 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
SH3BP2-203ENST00000442312 LAMA5O15230 3695 aa6.09□□□□□ -1.44
SH3BP2-203ENST00000442312 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.08□□□□□ -1.44
SH3BP2-203ENST00000442312 RELNP78509 3460 aa6.07□□□□□ -1.44
SH3BP2-203ENST00000442312 DMDP11532 3685 aa6.03□□□□□ -1.44
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.02□□□□□ -1.44
SH3BP2-203ENST00000442312 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.02□□□□□ -1.45
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.97□□□□□ -1.45
SH3BP2-203ENST00000442312 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.95□□□□□ -1.46
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
SH3BP2-203ENST00000442312 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.93□□□□□ -1.46
SH3BP2-203ENST00000442312 VPS13CQ709C8 3753 aa5.92□□□□□ -1.46
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.83□□□□□ -1.48
SH3BP2-203ENST00000442312 AKAP9Q99996 3911 aa5.82□□□□□ -1.48
SH3BP2-203ENST00000442312 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.75□□□□□ -1.49
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.68□□□□□ -1.5
SH3BP2-203ENST00000442312 CUBNO60494 3623 aa5.66□□□□□ -1.5
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP10-12P60413 245 aa5.65□□□□□ -1.5
SH3BP2-203ENST00000442312 MUC3AQ02505 3323 aa5.64□□□□□ -1.51
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.63□□□□□ -1.51
SH3BP2-203ENST00000442312 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.54□□□□□ -1.52
SH3BP2-203ENST00000442312 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.54□□□□□ -1.52
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP12-3P60328 96 aa5.51□□□□□ -1.53
SH3BP2-203ENST00000442312 BSNQ9UPA5 3926 aa5.45□□□□□ -1.54
SH3BP2-203ENST00000442312 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.35□□□□□ -1.55
SH3BP2-203ENST00000442312 MT1HL1P0DM35 61 aa5.33□□□□□ -1.56
SH3BP2-203ENST00000442312 LCE3AQ5TA76 89 aa5.3□□□□□ -1.56
SH3BP2-203ENST00000442312 LYSTQ99698 3801 aa5.29□□□□□ -1.56
SH3BP2-203ENST00000442312 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
SH3BP2-203ENST00000442312 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.18□□□□□ -1.58
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