RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438777.5

CCDC18-AS1-211, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 752 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A0A0G2JQZ4 141 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MT-ATP8P03928 68 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IGKV2-30P06310 120 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NREPQ16612 68 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.31□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 Q96NJ1 140 aa3.3□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 J3KT08 172 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPINK1P00995 79 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.29□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 BPY2O14599 106 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DSCR10P59022 87 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP10-8P60410 259 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.28□□□□□ -1.88
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PRR26Q8N8Z3 221 aa3.27□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LIMD2Q9BT23 127 aa3.27□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.26□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A8MWP4 228 aa3.26□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IGKV4-1P06312 121 aa3.26□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.26□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A0A0A0MQY5 61 aa3.25□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 K7EQZ3 153 aa3.24□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 OXTP01178 125 aa3.24□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MT1HL1P0DM35 61 aa3.24□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C1orf195Q5TG92 126 aa3.24□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PRR15Q8IV56 129 aa3.24□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TNXBP22105 4242 aa3.24□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.23□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.23□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A0A087WVE0 104 aa3.22□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.22□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.22□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A0A1B0GVX0 72 aa3.22□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.22□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.22□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.89
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.21□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C8orf87E5RJ46 101 aa3.21□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATOX1O00244 68 aa3.21□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NDUFB1O75438 58 aa3.21□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 Q8N9L7 120 aa3.21□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HERC2O95714 4834 aa3.21□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HCG22E2RYF7 251 aa3.2□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.2□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.2□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MYCBP2O75592 4640 aa3.2□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.19□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.18□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.18□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.18□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 OCR1Q9BZK8 76 aa3.18□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.17□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 hDV103S1A0JD37 113 aa3.17□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.17□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CASC2Q6XLA1 102 aa3.17□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.16□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.16□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SERP2Q8N6R1 65 aa3.16□□□□□ -1.9
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 COX7CP15954 63 aa3.15□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LINC00313P59037 77 aa3.15□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.15□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 UQCRQO14949 82 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.14□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.13□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 H3BPC8 53 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KLKP1Q107X0 134 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C5orf47Q569G3 176 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.12□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A8MUU9 505 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TPRXLQ17RH7 258 aa3.11□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A0A0U1RQV1 116 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 Q75L30 129 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RETNLBQ9BQ08 111 aa3.1□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.09□□□□□ -1.91
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CCDC179H3BU77 68 aa3.08□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NDUFC1O43677 76 aa3.07□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 Q5W150 140 aa3.07□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 H0Y9P7 68 aa3.06□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MP68P56378 58 aa3.06□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C20orf197Q8N268 126 aa3.06□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.05□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C9orf92A6NGG3 77 aa3.05□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 H7BZZ5 65 aa3.05□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NDUFS5O43920 106 aa3.05□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.05□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PRR4Q16378 134 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms