RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 Q5XG85 94 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-202ENST00000435136 hDV103S1A0JD37 113 aa10.92□□□□□ -0.66
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-202ENST00000435136 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-202ENST00000435136 H3BPC8 53 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa10.9□□□□□ -0.66
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A087X002 238 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 MP68P56378 58 aa10.9□□□□□ -0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 FAT1Q14517 4588 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SPINK6Q6UWN8 80 aa10.86□□□□□ -0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SERP1Q9Y6X1 66 aa10.85□□□□□ -0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP2-202ENST00000435136 PCLOQ9Y6V0 5065 aa10.83□□□□□ -0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 Q8N1X5 172 aa10.81□□□□□ -0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 C8orf87E5RJ46 101 aa10.81□□□□□ -0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 H0Y9P7 68 aa10.81□□□□□ -0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 LIMD2Q9BT23 127 aa10.81□□□□□ -0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCA13Q86UQ4 5058 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP10.78□□□□□ -0.68
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00208Q96KT6 92 aa10.76□□□□□ -0.69
SH3BP2-202ENST00000435136 TYMSOSQ8TAI1 123 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-202ENST00000435136 OXTP01178 125 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP2-202ENST00000435136 C1orf195Q5TG92 126 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-202ENST00000435136 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-202ENST00000435136 SPINK1P00995 79 aa10.73□□□□□ -0.69
SH3BP2-202ENST00000435136 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-202ENST00000435136 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-202ENST00000435136 Q5VSD8 79 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP2-202ENST00000435136 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-202ENST00000435136 C1orf64Q8NEQ6 169 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP2-202ENST00000435136 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-202ENST00000435136 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP2-202ENST00000435136 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP2-202ENST00000435136 NDUFS5O43920 106 aa10.67□□□□□ -0.7
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP10.67□□□□□ -0.7
SH3BP2-202ENST00000435136 FAM229AH3BQW9 127 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00313P59037 77 aa10.64□□□□□ -0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 SMIM26A0A096LP01 95 aa10.62□□□□□ -0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
SH3BP2-202ENST00000435136 MYCBP2O75592 4640 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.56□□□□□ -0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.52□□□□□ -0.72
SH3BP2-202ENST00000435136 Q5W150 140 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP2-202ENST00000435136 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
SH3BP2-202ENST00000435136 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
SH3BP2-202ENST00000435136 PRR4Q16378 134 aa10.46□□□□□ -0.74
SH3BP2-202ENST00000435136 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP2-202ENST00000435136 PCOTHQ58A44 107 aa10.44□□□□□ -0.74
SH3BP2-202ENST00000435136 C4orf26Q17RF5 130 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 HERC1Q15751 4861 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.37□□□□□ -0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 IGKV2-30P06310 120 aa10.36□□□□□ -0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP2-202ENST00000435136 Q1T7F1 81 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP2-202ENST00000435136 COA5Q86WW8 74 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP2-202ENST00000435136 V9GYY9 64 aa10.3□□□□□ -0.76
SH3BP2-202ENST00000435136 J3QL48 77 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP10-8P60410 259 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP2-202ENST00000435136 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.27□□□□□ -0.77
SH3BP2-202ENST00000435136 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-202ENST00000435136 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-202ENST00000435136 HRES1P13985 223 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP2-202ENST00000435136 A8MUU9 505 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP2-202ENST00000435136 DMAC1Q96GE9 116 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-202ENST00000435136 MT1HL1P0DM35 61 aa10.22□□□□□ -0.77
SH3BP2-202ENST00000435136 ACYP2P14621 99 aa10.21□□□□□ -0.78
SH3BP2-202ENST00000435136 TNXBP22105 4242 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP2-202ENST00000435136 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-202ENST00000435136 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.17□□□□□ -0.78
SH3BP2-202ENST00000435136 C9orf92A6NGG3 77 aa10.15□□□□□ -0.78
SH3BP2-202ENST00000435136 Q75L30 129 aa10.11□□□□□ -0.79
SH3BP2-202ENST00000435136 SVIPQ8NHG7 77 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa10.06□□□□□ -0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 A8MUN3 132 aa10.04□□□□□ -0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 PSPHP1O15172 72 aa10.02□□□□□ -0.8
SH3BP2-202ENST00000435136 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa10.02□□□□□ -0.81
SH3BP2-202ENST00000435136 Q5VV11 94 aa9.99□□□□□ -0.81
SH3BP2-202ENST00000435136 PRR15LQ9BU68 103 aa9.98□□□□□ -0.81
SH3BP2-202ENST00000435136 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.97□□□□□ -0.81
SH3BP2-202ENST00000435136 PRO0628Q9UI54 55 aa9.96□□□□□ -0.81
SH3BP2-202ENST00000435136 BRK1Q8WUW1 75 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 SPINK7P58062 85 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.9□□□□□ -0.82
SH3BP2-202ENST00000435136 XP32Q5T750 250 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP2-202ENST00000435136 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP2-202ENST00000435136 LRP2P98164 4655 aa9.79□□□□□ -0.84
SH3BP2-202ENST00000435136 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-202ENST00000435136 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.78□□□□□ -0.84
SH3BP2-202ENST00000435136 TPRXLQ17RH7 258 aa9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.2 ms