RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAT1Q14517 4588 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCOTHQ58A44 107 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CD164Q04900 197 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C1orf195Q5TG92 126 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q5W150 140 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RYR2Q92736 4967 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H3BPC8 53 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00313P59037 77 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A1B0GVY2 172 aa7.21□□□□□ -1.25
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LIMD2Q9BT23 127 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C8orf87E5RJ46 101 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PSPHP1O15172 72 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COA5Q86WW8 74 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPINK1P00995 79 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RYR3Q15413 4870 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BRK1Q8WUW1 75 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM229AH3BQW9 127 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A8MUN3 132 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q1T7F1 81 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGKV2-30P06310 120 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HRES1P13985 223 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C9orf92A6NGG3 77 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HSPG2P98160 4391 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRR15LQ9BU68 103 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q5VV11 94 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A8MU10 97 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRO0628Q9UI54 55 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MYCBP2O75592 4640 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q5VSD8 79 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 V9GYY9 64 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q8N1X5 172 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ACYP2P14621 99 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DMAC1Q96GE9 116 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TNXBP22105 4242 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RYR1P21817 5038 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A6NED7 52 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A8MUU9 505 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q75L30 129 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP10-8P60410 259 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPINK7P58062 85 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LCA10Q71F78 164 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A1B0GU69 56 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MT1HL1P0DM35 61 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PMAIP1Q13794 54 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LPAP08519 4548 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 XP32Q5T750 250 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LRP2P98164 4655 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.58□□□□□ -1.36
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