RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SVIPQ8NHG7 77 aa6.91□□□□□ -1.3
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.9□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.9□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 H3BQ85 93 aa6.89□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.87□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SSPOA2VEC9 5147 aa6.87□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USH2AO75445 5202 aa6.86□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.86□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.86□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ACYP1P07311 99 aa6.86□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6Q795 121 aa6.86□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZQY7 126 aa6.86□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.86□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIGMAR1Q99720 223 aa6.86□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.85□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 F8WEM9 126 aa6.84□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.84□□□□□ -1.31
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.83□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q75L30 129 aa6.83□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.8□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GV72 72 aa6.8□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6JHZ5 121 aa6.79□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT-ATP8P03928 68 aa6.79□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCKP06307 115 aa6.79□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGFL1Q6UW32 110 aa6.78□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.78□□□□□ -1.32
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSCR8Q96T75 97 aa6.77□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.76□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SCGB1A1P11684 91 aa6.76□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PDE6GP18545 87 aa6.76□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00643Q86TS7 51 aa6.75□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCP4P48539 62 aa6.73□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZQT0 140 aa6.73□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q96NJ1 140 aa6.73□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.72□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.72□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00846Q9NV44 126 aa6.72□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.71□□□□□ -1.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MUU9 505 aa6.68□□□□□ -1.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UBL5Q9BZL1 73 aa6.68□□□□□ -1.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IMUPQ9GZP8 106 aa6.68□□□□□ -1.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.67□□□□□ -1.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.66□□□□□ -1.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT2AP02795 61 aa6.66□□□□□ -1.34
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCE4AQ5TA78 99 aa6.65□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.65□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.63□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GW54 56 aa6.61□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q6ZVQ6 151 aa6.61□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.61□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.6□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT1FP04733 61 aa6.6□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM236CP0DP71 79 aa6.6□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DSCR10P59022 87 aa6.6□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LCE1DQ5T752 114 aa6.6□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WSZ3 146 aa6.59□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1W2PNM2 257 aa6.58□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.57□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.57□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.56□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.56□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXCL6P80162 114 aa6.56□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NREPQ16612 68 aa6.56□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.56□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.55□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP10-10P60014 251 aa6.54□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.54□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HRES1P13985 223 aa6.53□□□□□ -1.36
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A087WVE0 104 aa6.52□□□□□ -1.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00313P59037 77 aa6.52□□□□□ -1.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATOX1O00244 68 aa6.5□□□□□ -1.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BPY2O14599 106 aa6.5□□□□□ -1.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGKV4-1P06312 121 aa6.47□□□□□ -1.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.47□□□□□ -1.37
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.46□□□□□ -1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.43□□□□□ -1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 Q8N9L7 120 aa6.42□□□□□ -1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.41□□□□□ -1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.41□□□□□ -1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC179H3BU77 68 aa6.41□□□□□ -1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 J3KT08 172 aa6.41□□□□□ -1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SERP2Q8N6R1 65 aa6.41□□□□□ -1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.41□□□□□ -1.38
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UQCRQO14949 82 aa6.4□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 COX7CP15954 63 aa6.4□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.4□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C8orf87E5RJ46 101 aa6.36□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7EQZ3 153 aa6.36□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NDUFB1O75438 58 aa6.36□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.35□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A0A1B0GVX0 72 aa6.34□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 A8MWP4 228 aa6.34□□□□□ -1.39
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
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