RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420709.5

PRAME-207, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2

Gene PRAME, Length 705 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-207ENST00000420709 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAME-207ENST00000420709 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.43□□□□□ -1.38
PRAME-207ENST00000420709 MT1FP04733 61 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAME-207ENST00000420709 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.42□□□□□ -1.38
PRAME-207ENST00000420709 BATFQ16520 125 aa6.41□□□□□ -1.38
PRAME-207ENST00000420709 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PRAME-207ENST00000420709 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-207ENST00000420709 HRES1P13985 223 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-207ENST00000420709 ATXN8Q156A1 80 aa6.4□□□□□ -1.38
PRAME-207ENST00000420709 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.39□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.39□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.39□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.38□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP10-10P60014 251 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.37□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 CCKP06307 115 aa6.36□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 DSCR8Q96T75 97 aa6.36□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.35□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.35□□□□□ -1.39
PRAME-207ENST00000420709 C9orf118A6NHY6 69 aa6.33□□□□□ -1.4
PRAME-207ENST00000420709 C9JAW5 83 aa6.32□□□□□ -1.4
PRAME-207ENST00000420709 VPS25Q9BRG1 176 aa6.32□□□□□ -1.4
PRAME-207ENST00000420709 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.31□□□□□ -1.4
PRAME-207ENST00000420709 TAX1BP3O14907 124 aa6.31□□□□□ -1.4
PRAME-207ENST00000420709 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-207ENST00000420709 A0A1W2PPM0 123 aa6.29□□□□□ -1.4
PRAME-207ENST00000420709 A0A1B0GVX0 72 aa6.28□□□□□ -1.4
PRAME-207ENST00000420709 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.28□□□□□ -1.4
PRAME-207ENST00000420709 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 C8orf87E5RJ46 101 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 PDE6GP18545 87 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 MTURNQ8N3F0 131 aa6.27□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 Q6ZQT0 140 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 A0A1B0GW54 56 aa6.25□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 H3BT86 120 aa6.24□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 SPINK7P58062 85 aa6.24□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.24□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 J3KT08 172 aa6.22□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.22□□□□□ -1.41
PRAME-207ENST00000420709 LINC00846Q9NV44 126 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-207ENST00000420709 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-207ENST00000420709 NDUFB1O75438 58 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-207ENST00000420709 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PRAME-207ENST00000420709 NREPQ16612 68 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-207ENST00000420709 A0A1B0GV90 55 aa6.15□□□□□ -1.42
PRAME-207ENST00000420709 A8MWP4 228 aa6.15□□□□□ -1.42
PRAME-207ENST00000420709 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.15□□□□□ -1.42
PRAME-207ENST00000420709 K7EP34 96 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-207ENST00000420709 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.11□□□□□ -1.43
PRAME-207ENST00000420709 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-207ENST00000420709 PRO0461Q9UI25 63 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-207ENST00000420709 Q6ZVQ6 151 aa6.09□□□□□ -1.43
PRAME-207ENST00000420709 PRR15Q8IV56 129 aa6.08□□□□□ -1.44
PRAME-207ENST00000420709 BPY2O14599 106 aa6.05□□□□□ -1.44
PRAME-207ENST00000420709 F8W1H4 67 aa6.04□□□□□ -1.44
PRAME-207ENST00000420709 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.03□□□□□ -1.44
PRAME-207ENST00000420709 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.03□□□□□ -1.44
PRAME-207ENST00000420709 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
PRAME-207ENST00000420709 K7EQZ3 153 aa6.02□□□□□ -1.45
PRAME-207ENST00000420709 NDUFS5O43920 106 aa6.01□□□□□ -1.45
PRAME-207ENST00000420709 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.01□□□□□ -1.45
PRAME-207ENST00000420709 UBL5Q9BZL1 73 aa6.01□□□□□ -1.45
PRAME-207ENST00000420709 hDV103S1A0JD37 113 aa5.99□□□□□ -1.45
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.99□□□□□ -1.45
PRAME-207ENST00000420709 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.98□□□□□ -1.45
PRAME-207ENST00000420709 IGKV2-30P06310 120 aa5.98□□□□□ -1.45
PRAME-207ENST00000420709 ETDBQ3ZM63 59 aa5.98□□□□□ -1.45
PRAME-207ENST00000420709 Q8N9L7 120 aa5.96□□□□□ -1.46
PRAME-207ENST00000420709 Q5W150 140 aa5.94□□□□□ -1.46
PRAME-207ENST00000420709 CASC2Q6XLA1 102 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-207ENST00000420709 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-207ENST00000420709 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-207ENST00000420709 C4orf26Q17RF5 130 aa5.89□□□□□ -1.47
PRAME-207ENST00000420709 NEBP20929 6669 aa5.88□□□□□ -1.47
PRAME-207ENST00000420709 HCG22E2RYF7 251 aa5.88□□□□□ -1.47
PRAME-207ENST00000420709 CXCL6P80162 114 aa5.88□□□□□ -1.47
PRAME-207ENST00000420709 ACYP1P07311 99 aa5.87□□□□□ -1.47
PRAME-207ENST00000420709 C5orf47Q569G3 176 aa5.87□□□□□ -1.47
PRAME-207ENST00000420709 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.85□□□□□ -1.47
PRAME-207ENST00000420709 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.85□□□□□ -1.47
PRAME-207ENST00000420709 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-207ENST00000420709 A6NN06 94 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-207ENST00000420709 MT1BP07438 61 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.8□□□□□ -1.48
PRAME-207ENST00000420709 Q5VV11 94 aa5.79□□□□□ -1.48
PRAME-207ENST00000420709 S4R3F8 94 aa5.79□□□□□ -1.48
PRAME-207ENST00000420709 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.78□□□□□ -1.48
PRAME-207ENST00000420709 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.78□□□□□ -1.48
PRAME-207ENST00000420709 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.78□□□□□ -1.48
PRAME-207ENST00000420709 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.75□□□□□ -1.49
PRAME-207ENST00000420709 LCA10Q71F78 164 aa5.75□□□□□ -1.49
PRAME-207ENST00000420709 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms