RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q9BRP9 147 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.02□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ERC2-IT1O76042 136 aa6.01□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRP2P98164 4655 aa6□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.99□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00483Q53H64 154 aa5.97□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C20orf197Q8N268 126 aa5.97□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.97□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.96□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LPAP08519 4548 aa5.96□□□□□ -1.45
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1B0GW54 56 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAM236CP0DP71 79 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KLKP1Q107X0 134 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.94□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MOBPQ13875 183 aa5.94□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NREPQ16612 68 aa5.94□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q8N377 158 aa5.94□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGKV4-1P06312 121 aa5.93□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRR4Q16378 134 aa5.93□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q8NBF4 154 aa5.93□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NDUFC1O43677 76 aa5.92□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.92□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.92□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H7BZZ5 65 aa5.91□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BPY2O14599 106 aa5.91□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.9□□□□□ -1.46
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.89□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1W2PNM2 257 aa5.88□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.88□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 F8WEM9 126 aa5.87□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPRR1BP22528 89 aa5.87□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SNURFQ9Y675 71 aa5.87□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q8N9L7 120 aa5.86□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.86□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 OCR1Q9BZK8 76 aa5.86□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C5orf47Q569G3 176 aa5.85□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.85□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPINK1P00995 79 aa5.84□□□□□ -1.47
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A0U1RQV1 116 aa5.83□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LCE1DQ5T752 114 aa5.83□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q5XG85 94 aa5.82□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMIM29Q86T20 159 aa5.82□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.81□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.81□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.81□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RNF213Q63HN8 5207 aa5.79□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.79□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DSCR10P59022 87 aa5.79□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGFL1Q6UW32 110 aa5.79□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A0G2JQZ4 141 aa5.78□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TPRXLQ17RH7 258 aa5.78□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HCG22E2RYF7 251 aa5.76□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 K7EQZ3 153 aa5.76□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C4orf26Q17RF5 130 aa5.76□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LIMD2Q9BT23 127 aa5.75□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MUC17Q685J3 4493 aa5.74□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CD164Q04900 197 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.73□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A087WSZ3 146 aa5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.72□□□□□ -1.49
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.71□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NDUFB1O75438 58 aa5.67□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MP68P56378 58 aa5.67□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.67□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 hDV103S1A0JD37 113 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A8MWP4 228 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H3BPC8 53 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRR15Q8IV56 129 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.66□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C9orf92A6NGG3 77 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C1orf195Q5TG92 126 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CASC2Q6XLA1 102 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.65□□□□□ -1.5
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MUC2Q02817 5179 aa5.65□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.62□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H0Y9P7 68 aa5.62□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PRO0628Q9UI54 55 aa5.62□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.6□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.6□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.6□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.6□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.6□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.6□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC00208Q96KT6 92 aa5.6□□□□□ -1.51
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q1T7F1 81 aa5.57□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q96NJ1 140 aa5.56□□□□□ -1.52
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.6 ms