RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393386.6

PTPRZ1-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRZ1, Length 8,175 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-201ENST00000393386 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRZ1-201ENST00000393386 C9orf92A6NGG3 77 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A087X002 238 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRZ1-201ENST00000393386 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP10-3P60369 221 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRZ1-201ENST00000393386 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRZ1-201ENST00000393386 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 S4R3F8 94 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 FBN3Q75N90 2809 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 Q6ZR54 194 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLAC4Q8WY50 150 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 TENM3Q9P273 2699 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 Q5W150 140 aa3.42□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 CUBNO60494 3623 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 R4GN34 69 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.39□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 AKAP9Q99996 3911 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 Q8NDZ9 215 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 PANO1I0J062 215 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 A8MUU9 505 aa3.35□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 CASC10Q5T4H9 136 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRZ1-201ENST00000393386 BSNQ9UPA5 3926 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 LCE6AA0A183 80 aa3.34□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPRR1AP35321 89 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 Q6ZSA8 131 aa3.33□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 A0A087WTM6 91 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 VPS13CQ709C8 3753 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 A8MU10 97 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 TENM2Q9NT68 2774 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 RYR2Q92736 4967 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 M0QZ58 72 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 RYR3Q15413 4870 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRZ1-201ENST00000393386 SPRR1BP22528 89 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 TGP01266 2768 aa3.27□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 K7EIL1 84 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 J3QL48 77 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP10-11P60412 298 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.25□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 RYR1P21817 5038 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 PP632Q6XCG6 107 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.22□□□□□ -1.89
PTPRZ1-201ENST00000393386 M0R2T5 61 aa3.21□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.19□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 COL7A1Q02388 2944 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 TNP1P09430 55 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 P0C880 135 aa3.16□□□□□ -1.9
PTPRZ1-201ENST00000393386 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRZ1-201ENST00000393386 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRZ1-201ENST00000393386 H0YAA0 97 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRZ1-201ENST00000393386 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRZ1-201ENST00000393386 FAT1Q14517 4588 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRZ1-201ENST00000393386 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRZ1-201ENST00000393386 HERC2O95714 4834 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRZ1-201ENST00000393386 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 RNF213Q63HN8 5207 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP10-8P60410 259 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRZ1-201ENST00000393386 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRZ1-201ENST00000393386 SACSQ9NZJ4 4579 aa3□□□□□ -1.93
PTPRZ1-201ENST00000393386 STARD9Q9P2P6 4700 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRZ1-201ENST00000393386 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
PTPRZ1-201ENST00000393386 INE1O15225 51 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRZ1-201ENST00000393386 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.98□□□□□ -1.93
PTPRZ1-201ENST00000393386 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa2.97□□□□□ -1.93
PTPRZ1-201ENST00000393386 HERC1Q15751 4861 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms