RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP0.37□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 NCOR2Q9Y618 2525 aa0.36□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB131AP59861 70 aa0.36□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 FLNCQ14315 2725 aa0.36□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 USP24Q9UPU5 2620 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 BSNQ9UPA5 3926 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 SPTBN4Q9H254 2564 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 COL6A5A8TX70 2615 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 CACNA1AO00555 2505 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ZZEF1O43149 2961 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 ACACAQ13085 2346 aa0.35□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 NF1P21359 2839 aa0.34□□□□□ -2.35
RABGGTB-202ENST00000370826 M0QY20 66 aa0.34□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC168Q8NDH2 2452 aa0.34□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.34□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRK2Q5S007 2527 aa0.34□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 STAB1Q9NY15 2570 aa0.33□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 LYSTQ99698 3801 aa0.33□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP0.33□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SPG11Q96JI7 2443 aa0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 IGSF10Q6WRI0 2623 aa0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SPRR2DP22532 72 aa0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL39P62891 51 aaKnown RBP0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP0.32□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM186AA6NE01 2351 aa0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CLPSL2Q6UWE3 100 aa0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 MTORP42345 2549 aa0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 MAST4O15021 2626 aa0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.31□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BNG1 76 aa0.3□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 TACC2O95359 2948 aa0.3□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 KMT2AQ03164 3969 aa0.3□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 MYCBP2O75592 4640 aa0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 DMXL1Q9Y485 3027 aa0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 EPG5Q9HCE0 2579 aa0.29□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 ACACBO00763 2458 aa0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 CHD7Q9P2D1 2997 aa0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf92A6NGG3 77 aa0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 A8MTW9 85 aa0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 KMT2DO14686 5537 aa0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 COL7A1Q02388 2944 aa0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 SONP18583 2426 aaKnown RBP0.28□□□□□ -2.36
RABGGTB-202ENST00000370826 PKD1P98161 4303 aa0.28□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 TLN2Q9Y4G6 2542 aa0.27□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 TNP1P09430 55 aa0.27□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 SPRR2BP35325 72 aa0.27□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.27□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 HIVEP1P15822 2718 aa0.27□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 TENM2Q9NT68 2774 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 M0QZ58 72 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 DEFB110Q30KQ9 67 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 LEAP2Q969E1 77 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 MYO18BQ8IUG5 2567 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ZANQ9Y493 2812 aa0.26□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa0.25□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 FASNP49327 2511 aaKnown RBP0.25□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.25□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP0.24□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 COL6A3P12111 3177 aa0.24□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 COL12A1Q99715 3063 aa0.24□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 TOMM7Q9P0U1 55 aa0.24□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 TGP01266 2768 aa0.24□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 KALRNO60229 2985 aa0.24□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP0.23□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ITPR3Q14573 2671 aa0.23□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 CUBNO60494 3623 aa0.23□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 SACSQ9NZJ4 4579 aa0.22□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 SPRR2AP35326 72 aa0.22□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa0.22□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP0.22□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 DNAH3Q8TD57 4116 aa0.22□□□□□ -2.37
RABGGTB-202ENST00000370826 FRYQ5TBA9 3013 aa0.21□□□□□ -2.38
RABGGTB-202ENST00000370826 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa0.21□□□□□ -2.38
RABGGTB-202ENST00000370826 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa0.21□□□□□ -2.38
RABGGTB-202ENST00000370826 LPAP08519 4548 aa0.21□□□□□ -2.38
RABGGTB-202ENST00000370826 NBEAQ8NFP9 2946 aa0.21□□□□□ -2.38
RABGGTB-202ENST00000370826 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.21□□□□□ -2.38
RABGGTB-202ENST00000370826 TTTY10Q9BZA0 68 aa0.21□□□□□ -2.38
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