RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.73□□□□□ -1.33
GINS3-202ENST00000328514 CDK2AP2O75956 126 aa6.72□□□□□ -1.33
GINS3-202ENST00000328514 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
GINS3-202ENST00000328514 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.72□□□□□ -1.33
GINS3-202ENST00000328514 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.72□□□□□ -1.33
GINS3-202ENST00000328514 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
GINS3-202ENST00000328514 RYR2Q92736 4967 aa6.71□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 PANO1I0J062 215 aa6.7□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 A0A087X002 238 aa6.69□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.69□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 ACYP2P14621 99 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 APLNQ9ULZ1 77 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.68□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 K7EIL1 84 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 Q5W150 140 aa6.67□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 DMAC1Q96GE9 116 aa6.66□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GINS3-202ENST00000328514 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 COL7A1Q02388 2944 aa6.63□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 C8orf87E5RJ46 101 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 LINC00313P59037 77 aa6.62□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 ZNF861PO60384 105 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 RYR1P21817 5038 aa6.61□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.6□□□□□ -1.35
GINS3-202ENST00000328514 HERC2O95714 4834 aa6.58□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.57□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GU69 56 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 FAM229AH3BQW9 127 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 RTL8CO15255 209 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.56□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.55□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 IGKV2-30P06310 120 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.53□□□□□ -1.36
GINS3-202ENST00000328514 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 PRAC1Q96KF2 57 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 A0A087WTM6 91 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.52□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 H3BS24 57 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 UQCR11O14957 56 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.51□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.5□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 LINC01554Q52M75 96 aa6.49□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 IGLV7-43P04211 117 aa6.48□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 NUPR2A6NF83 97 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.47□□□□□ -1.37
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.44□□□□□ -1.38
GINS3-202ENST00000328514 DNAH2Q9P225 4427 aa6.41□□□□□ -1.38
GINS3-202ENST00000328514 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.4□□□□□ -1.38
GINS3-202ENST00000328514 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.39□□□□□ -1.39
GINS3-202ENST00000328514 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.36□□□□□ -1.39
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.34□□□□□ -1.39
GINS3-202ENST00000328514 CSAG1Q6PB30 78 aa6.33□□□□□ -1.4
GINS3-202ENST00000328514 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.32□□□□□ -1.4
GINS3-202ENST00000328514 KMT2AQ03164 3969 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS3-202ENST00000328514 LY6G6CO95867 125 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS3-202ENST00000328514 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS3-202ENST00000328514 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.29□□□□□ -1.4
GINS3-202ENST00000328514 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS3-202ENST00000328514 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS3-202ENST00000328514 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.26□□□□□ -1.41
GINS3-202ENST00000328514 A8MUU9 505 aa6.25□□□□□ -1.41
GINS3-202ENST00000328514 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.24□□□□□ -1.41
GINS3-202ENST00000328514 Q6ZSA8 131 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS3-202ENST00000328514 H0YAA0 97 aa6.23□□□□□ -1.41
GINS3-202ENST00000328514 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.21□□□□□ -1.41
GINS3-202ENST00000328514 SPINK1P00995 79 aa6.2□□□□□ -1.42
GINS3-202ENST00000328514 Q8N1X5 172 aa6.19□□□□□ -1.42
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.19□□□□□ -1.42
GINS3-202ENST00000328514 A0A0A0MQY5 61 aa6.18□□□□□ -1.42
GINS3-202ENST00000328514 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.17□□□□□ -1.42
GINS3-202ENST00000328514 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP10-2P60368 255 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS3-202ENST00000328514 HERC1Q15751 4861 aa6.16□□□□□ -1.42
GINS3-202ENST00000328514 A0A1B0GU33 70 aa6.15□□□□□ -1.43
GINS3-202ENST00000328514 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.14□□□□□ -1.43
GINS3-202ENST00000328514 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.13□□□□□ -1.43
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.13□□□□□ -1.43
GINS3-202ENST00000328514 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.12□□□□□ -1.43
GINS3-202ENST00000328514 PKD1P98161 4303 aa6.12□□□□□ -1.43
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP10-1P60331 282 aa6.1□□□□□ -1.43
GINS3-202ENST00000328514 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.1□□□□□ -1.43
GINS3-202ENST00000328514 ROMO1P60602 79 aa6.09□□□□□ -1.43
GINS3-202ENST00000328514 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.09□□□□□ -1.44
GINS3-202ENST00000328514 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.06□□□□□ -1.44
GINS3-202ENST00000328514 K7ERS5 55 aa6.03□□□□□ -1.44
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