RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325599.12

SHQ1-201, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHQ1, Length 2,879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZR54 194 aa9.88□□□□□ -0.83
SHQ1-201ENST00000325599 DNHD1Q96M86 4753 aa9.85□□□□□ -0.83
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.85□□□□□ -0.83
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00483Q53H64 154 aa9.85□□□□□ -0.83
SHQ1-201ENST00000325599 Q96NJ1 140 aa9.85□□□□□ -0.83
SHQ1-201ENST00000325599 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.84□□□□□ -0.83
SHQ1-201ENST00000325599 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.83□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 COA5Q86WW8 74 aa9.83□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.83□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.82□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.82□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 H0Y9P7 68 aa9.82□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 SPINK7P58062 85 aa9.8□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00313P59037 77 aa9.8□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF861PO60384 105 aa9.79□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 C1orf134Q5TEV5 83 aa9.78□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.78□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.78□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.84
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.77□□□□□ -0.85
SHQ1-201ENST00000325599 LY6G6CO95867 125 aa9.76□□□□□ -0.85
SHQ1-201ENST00000325599 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.73□□□□□ -0.85
SHQ1-201ENST00000325599 PCOTHQ58A44 107 aa9.72□□□□□ -0.85
SHQ1-201ENST00000325599 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.71□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 A0A087X002 238 aa9.69□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV7-43P04211 117 aa9.69□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.69□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.69□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.69□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.69□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 LINC01554Q52M75 96 aa9.69□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 ALMS1Q8TCU4 4167 aa9.69□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 H3BPC8 53 aa9.68□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP10-2P60368 255 aa9.68□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GVX0 72 aa9.68□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.66□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.65□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.65□□□□□ -0.86
SHQ1-201ENST00000325599 CDK2AP2O75956 126 aa9.65□□□□□ -0.87
SHQ1-201ENST00000325599 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.64□□□□□ -0.87
SHQ1-201ENST00000325599 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.62□□□□□ -0.87
SHQ1-201ENST00000325599 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.62□□□□□ -0.87
SHQ1-201ENST00000325599 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.6□□□□□ -0.87
SHQ1-201ENST00000325599 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SHQ1-201ENST00000325599 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.57□□□□□ -0.88
SHQ1-201ENST00000325599 PKD1P98161 4303 aa9.55□□□□□ -0.88
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP10-1P60331 282 aa9.54□□□□□ -0.88
SHQ1-201ENST00000325599 HRES1P13985 223 aa9.51□□□□□ -0.89
SHQ1-201ENST00000325599 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.51□□□□□ -0.89
SHQ1-201ENST00000325599 Q5W150 140 aa9.51□□□□□ -0.89
SHQ1-201ENST00000325599 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.5□□□□□ -0.89
SHQ1-201ENST00000325599 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.49□□□□□ -0.89
SHQ1-201ENST00000325599 Q6ZSA8 131 aa9.47□□□□□ -0.89
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.47□□□□□ -0.89
SHQ1-201ENST00000325599 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.45□□□□□ -0.9
SHQ1-201ENST00000325599 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.44□□□□□ -0.9
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.42□□□□□ -0.9
SHQ1-201ENST00000325599 CSAG1Q6PB30 78 aa9.42□□□□□ -0.9
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.39□□□□□ -0.91
SHQ1-201ENST00000325599 PKHD1P08F94 4074 aa9.33□□□□□ -0.92
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.27□□□□□ -0.92
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GU69 56 aa9.26□□□□□ -0.93
SHQ1-201ENST00000325599 FAM229AH3BQW9 127 aa9.25□□□□□ -0.93
SHQ1-201ENST00000325599 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.25□□□□□ -0.93
SHQ1-201ENST00000325599 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.25□□□□□ -0.93
SHQ1-201ENST00000325599 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.23□□□□□ -0.93
SHQ1-201ENST00000325599 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.22□□□□□ -0.93
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV2-30P06310 120 aa9.2□□□□□ -0.94
SHQ1-201ENST00000325599 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
SHQ1-201ENST00000325599 ACYP2P14621 99 aa9.18□□□□□ -0.94
SHQ1-201ENST00000325599 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
SHQ1-201ENST00000325599 SPINK1P00995 79 aa9.16□□□□□ -0.94
SHQ1-201ENST00000325599 DMAC1Q96GE9 116 aa9.16□□□□□ -0.94
SHQ1-201ENST00000325599 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa9.15□□□□□ -0.94
SHQ1-201ENST00000325599 UQCR11O14957 56 aa9.15□□□□□ -0.94
SHQ1-201ENST00000325599 FAT1Q14517 4588 aa9.13□□□□□ -0.95
SHQ1-201ENST00000325599 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.11□□□□□ -0.95
SHQ1-201ENST00000325599 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
SHQ1-201ENST00000325599 ROMO1P60602 79 aa9.06□□□□□ -0.96
SHQ1-201ENST00000325599 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SHQ1-201ENST00000325599 A0A1B0GVY2 172 aa9.02□□□□□ -0.97
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
SHQ1-201ENST00000325599 C9orf92A6NGG3 77 aa8.99□□□□□ -0.97
SHQ1-201ENST00000325599 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.98□□□□□ -0.97
SHQ1-201ENST00000325599 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.95□□□□□ -0.98
SHQ1-201ENST00000325599 Q8N1X5 172 aa8.95□□□□□ -0.98
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.94□□□□□ -0.98
SHQ1-201ENST00000325599 RYR2Q92736 4967 aa8.94□□□□□ -0.98
SHQ1-201ENST00000325599 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SHQ1-201ENST00000325599 CRIPTQ9P021 101 aa8.92□□□□□ -0.98
SHQ1-201ENST00000325599 P0C880 135 aa8.88□□□□□ -0.99
SHQ1-201ENST00000325599 A8MUU9 505 aa8.85□□□□□ -0.99
SHQ1-201ENST00000325599 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.84□□□□□ -0.99
SHQ1-201ENST00000325599 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
SHQ1-201ENST00000325599 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.76□□□□□ -1.01
SHQ1-201ENST00000325599 H0YAA0 97 aa8.71□□□□□ -1.01
SHQ1-201ENST00000325599 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.71□□□□□ -1.01
SHQ1-201ENST00000325599 TNXBP22105 4242 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-201ENST00000325599 HSPG2P98160 4391 aa8.67□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.2 ms