RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325558.10

PGA3-201, Transcript of pepsinogen 3, group I (pepsinogen A), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGA3, Length 1,748 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3-201ENST00000325558 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.53□□□□□ -1.36
PGA3-201ENST00000325558 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.53□□□□□ -1.36
PGA3-201ENST00000325558 H3BPC8 53 aa6.5□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.5□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 C1orf195Q5TG92 126 aa6.5□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.49□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 FAT1Q14517 4588 aa6.48□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.48□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 MP68P56378 58 aa6.47□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.47□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 H0Y9P7 68 aa6.47□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 CDK2AP2O75956 126 aa6.47□□□□□ -1.37
PGA3-201ENST00000325558 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.46□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 C8orf87E5RJ46 101 aa6.45□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 LINC00208Q96KT6 92 aa6.45□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.45□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 SPINK1P00995 79 aa6.43□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.43□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.43□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.42□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.42□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.42□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 LIMD2Q9BT23 127 aa6.42□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.4□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 SVIPQ8NHG7 77 aa6.4□□□□□ -1.38
PGA3-201ENST00000325558 LINC00313P59037 77 aa6.39□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 Q5W150 140 aa6.39□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.39□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.38□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.36□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.36□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 HSPG2P98160 4391 aa6.36□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.34□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 NDUFS5O43920 106 aa6.34□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 RYR1P21817 5038 aa6.34□□□□□ -1.39
PGA3-201ENST00000325558 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.33□□□□□ -1.4
PGA3-201ENST00000325558 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.3□□□□□ -1.4
PGA3-201ENST00000325558 TNXBP22105 4242 aa6.3□□□□□ -1.4
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.3□□□□□ -1.4
PGA3-201ENST00000325558 FAM229AH3BQW9 127 aa6.28□□□□□ -1.4
PGA3-201ENST00000325558 PRR4Q16378 134 aa6.28□□□□□ -1.4
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP10-8P60410 259 aa6.28□□□□□ -1.4
PGA3-201ENST00000325558 C4orf26Q17RF5 130 aa6.26□□□□□ -1.41
PGA3-201ENST00000325558 PCOTHQ58A44 107 aa6.26□□□□□ -1.41
PGA3-201ENST00000325558 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.25□□□□□ -1.41
PGA3-201ENST00000325558 IGKV2-30P06310 120 aa6.24□□□□□ -1.41
PGA3-201ENST00000325558 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PGA3-201ENST00000325558 Q5VSD8 79 aa6.22□□□□□ -1.41
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PGA3-201ENST00000325558 Q8N1X5 172 aa6.21□□□□□ -1.42
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PGA3-201ENST00000325558 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.2□□□□□ -1.42
PGA3-201ENST00000325558 A8MUU9 505 aa6.19□□□□□ -1.42
PGA3-201ENST00000325558 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.19□□□□□ -1.42
PGA3-201ENST00000325558 HRES1P13985 223 aa6.18□□□□□ -1.42
PGA3-201ENST00000325558 COA5Q86WW8 74 aa6.17□□□□□ -1.42
PGA3-201ENST00000325558 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.16□□□□□ -1.42
PGA3-201ENST00000325558 DMAC1Q96GE9 116 aa6.14□□□□□ -1.43
PGA3-201ENST00000325558 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.13□□□□□ -1.43
PGA3-201ENST00000325558 MT1HL1P0DM35 61 aa6.13□□□□□ -1.43
PGA3-201ENST00000325558 HERC2O95714 4834 aa6.12□□□□□ -1.43
PGA3-201ENST00000325558 C9orf92A6NGG3 77 aa6.1□□□□□ -1.43
PGA3-201ENST00000325558 ACYP2P14621 99 aa6.08□□□□□ -1.44
PGA3-201ENST00000325558 Q75L30 129 aa6.08□□□□□ -1.44
PGA3-201ENST00000325558 V9GYY9 64 aa6.08□□□□□ -1.44
PGA3-201ENST00000325558 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.08□□□□□ -1.44
PGA3-201ENST00000325558 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.06□□□□□ -1.44
PGA3-201ENST00000325558 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.05□□□□□ -1.44
PGA3-201ENST00000325558 A8MUN3 132 aa6.02□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 Q5VV11 94 aa6.02□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.01□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 PSPHP1O15172 72 aa6□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 MYCBP2O75592 4640 aa5.99□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.99□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 SPINK7P58062 85 aa5.98□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.97□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 XP32Q5T750 250 aa5.96□□□□□ -1.45
PGA3-201ENST00000325558 PRR15LQ9BU68 103 aa5.95□□□□□ -1.46
PGA3-201ENST00000325558 PRO0628Q9UI54 55 aa5.94□□□□□ -1.46
PGA3-201ENST00000325558 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.93□□□□□ -1.46
PGA3-201ENST00000325558 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.91□□□□□ -1.46
PGA3-201ENST00000325558 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.9□□□□□ -1.47
PGA3-201ENST00000325558 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.88□□□□□ -1.47
PGA3-201ENST00000325558 BRK1Q8WUW1 75 aa5.88□□□□□ -1.47
PGA3-201ENST00000325558 TPRXLQ17RH7 258 aa5.87□□□□□ -1.47
PGA3-201ENST00000325558 LCA10Q71F78 164 aa5.85□□□□□ -1.47
PGA3-201ENST00000325558 A8MU10 97 aa5.83□□□□□ -1.48
PGA3-201ENST00000325558 LRP2P98164 4655 aa5.8□□□□□ -1.48
PGA3-201ENST00000325558 A0A1B0GU69 56 aa5.79□□□□□ -1.48
PGA3-201ENST00000325558 A6NED7 52 aa5.79□□□□□ -1.48
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