RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.94□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 ATOX1O00244 68 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFB1O75438 58 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.93□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 DSCR10P59022 87 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N9L7 120 aa5.92□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV4-1P06312 121 aa5.91□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
RABGGTB-201ENST00000319942 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MWP4 228 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.9□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 K7EQZ3 153 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 Q5XG85 94 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR15Q8IV56 129 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.89□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 SPINK1P00995 79 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 LIMD2Q9BT23 127 aa5.88□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 PKHD1P08F94 4074 aa5.87□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 Q5VSD8 79 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 Q96NJ1 140 aa5.86□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 HCG22E2RYF7 251 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 SERP2Q8N6R1 65 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.85□□□□□ -1.47
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 UQCRQO14949 82 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 COX7CP15954 63 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 CASC2Q6XLA1 102 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A1B0GVX0 72 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf195Q5TG92 126 aa5.81□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.8□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 hDV103S1A0JD37 113 aa5.79□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.78□□□□□ -1.48
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC179H3BU77 68 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 OCR1Q9BZK8 76 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 FAT1Q14517 4588 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 C8orf87E5RJ46 101 aa5.77□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 RYR3Q15413 4870 aa5.76□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00313P59037 77 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-8P60410 259 aa5.75□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 C5orf47Q569G3 176 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.74□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.73□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf197Q8N268 126 aa5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFS5O43920 106 aa5.71□□□□□ -1.49
RABGGTB-201ENST00000319942 MP68P56378 58 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-201ENST00000319942 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.71□□□□□ -1.5
RABGGTB-201ENST00000319942 OXTP01178 125 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-201ENST00000319942 KLKP1Q107X0 134 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-201ENST00000319942 HSPG2P98160 4391 aa5.68□□□□□ -1.5
RABGGTB-201ENST00000319942 H3BPC8 53 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-201ENST00000319942 NDUFC1O43677 76 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-201ENST00000319942 SNURFQ9Y675 71 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-201ENST00000319942 RYR1P21817 5038 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-201ENST00000319942 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 A0A0U1RQV1 116 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 H0Y9P7 68 aa5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 LINC00208Q96KT6 92 aa5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.62□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 MT1HL1P0DM35 61 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.61□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 TMEM258P61165 79 aa5.6□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 H7BZZ5 65 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.59□□□□□ -1.51
RABGGTB-201ENST00000319942 LCE1EQ5T753 118 aa5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf92A6NGG3 77 aa5.57□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.56□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 Q5W150 140 aa5.55□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.54□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MUU9 505 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM236CP0DP71 79 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PRR4Q16378 134 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.51□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 Q75L30 129 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.5□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms