RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000294599.8

MEGF6-201, Transcript of multiple EGF like domains 6, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MEGF6, Length 4,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
MEGF6-201ENST00000294599 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.86□□□□□ -0.83
MEGF6-201ENST00000294599 Q5W150 140 aa9.83□□□□□ -0.84
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.83□□□□□ -0.84
MEGF6-201ENST00000294599 TENM3Q9P273 2699 aa9.81□□□□□ -0.84
MEGF6-201ENST00000294599 SPINK7P58062 85 aa9.8□□□□□ -0.84
MEGF6-201ENST00000294599 PRAC1Q96KF2 57 aa9.78□□□□□ -0.84
MEGF6-201ENST00000294599 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.77□□□□□ -0.85
MEGF6-201ENST00000294599 CUBNO60494 3623 aa9.75□□□□□ -0.85
MEGF6-201ENST00000294599 LCE6AA0A183 80 aa9.74□□□□□ -0.85
MEGF6-201ENST00000294599 VWFP04275 2813 aa9.73□□□□□ -0.85
MEGF6-201ENST00000294599 LINC00483Q53H64 154 aa9.73□□□□□ -0.85
MEGF6-201ENST00000294599 TENM4Q6N022 2769 aa9.73□□□□□ -0.85
MEGF6-201ENST00000294599 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
MEGF6-201ENST00000294599 Q6ZSA8 131 aa9.7□□□□□ -0.86
MEGF6-201ENST00000294599 Q6ZR54 194 aa9.67□□□□□ -0.86
MEGF6-201ENST00000294599 A0A087X002 238 aa9.65□□□□□ -0.86
MEGF6-201ENST00000294599 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.65□□□□□ -0.86
MEGF6-201ENST00000294599 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
MEGF6-201ENST00000294599 DMAC1Q96GE9 116 aa9.61□□□□□ -0.87
MEGF6-201ENST00000294599 PDZD2O15018 2839 aa9.61□□□□□ -0.87
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP10-2P60368 255 aa9.61□□□□□ -0.87
MEGF6-201ENST00000294599 CSAG1Q6PB30 78 aa9.6□□□□□ -0.87
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP10-1P60331 282 aa9.59□□□□□ -0.87
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.58□□□□□ -0.88
MEGF6-201ENST00000294599 BSNQ9UPA5 3926 aa9.57□□□□□ -0.88
MEGF6-201ENST00000294599 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.56□□□□□ -0.88
MEGF6-201ENST00000294599 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
MEGF6-201ENST00000294599 LUZP6Q538Z0 58 aa9.54□□□□□ -0.88
MEGF6-201ENST00000294599 OTOGQ6ZRI0 2925 aa9.54□□□□□ -0.88
MEGF6-201ENST00000294599 S4R3F8 94 aa9.5□□□□□ -0.89
MEGF6-201ENST00000294599 CSMD2Q7Z408 3487 aa9.45□□□□□ -0.9
MEGF6-201ENST00000294599 A8MU10 97 aa9.44□□□□□ -0.9
MEGF6-201ENST00000294599 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
MEGF6-201ENST00000294599 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa9.43□□□□□ -0.9
MEGF6-201ENST00000294599 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.42□□□□□ -0.9
MEGF6-201ENST00000294599 R4GN34 69 aa9.41□□□□□ -0.9
MEGF6-201ENST00000294599 H3BS24 57 aa9.38□□□□□ -0.91
MEGF6-201ENST00000294599 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.38□□□□□ -0.91
MEGF6-201ENST00000294599 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.37□□□□□ -0.91
MEGF6-201ENST00000294599 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.34□□□□□ -0.91
MEGF6-201ENST00000294599 Q5VSD8 79 aa9.33□□□□□ -0.92
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.33□□□□□ -0.92
MEGF6-201ENST00000294599 ROMO1P60602 79 aa9.32□□□□□ -0.92
MEGF6-201ENST00000294599 M0R2T5 61 aa9.3□□□□□ -0.92
MEGF6-201ENST00000294599 TGP01266 2768 aa9.27□□□□□ -0.92
MEGF6-201ENST00000294599 A6NN06 94 aa9.26□□□□□ -0.93
MEGF6-201ENST00000294599 TENM2Q9NT68 2774 aa9.25□□□□□ -0.93
MEGF6-201ENST00000294599 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
MEGF6-201ENST00000294599 ZFHX3Q15911 3703 aa9.24□□□□□ -0.93
MEGF6-201ENST00000294599 M0QZ58 72 aa9.23□□□□□ -0.93
MEGF6-201ENST00000294599 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.17□□□□□ -0.94
MEGF6-201ENST00000294599 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa9.14□□□□□ -0.95
MEGF6-201ENST00000294599 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
MEGF6-201ENST00000294599 RPS29P62273 56 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
MEGF6-201ENST00000294599 VPS13CQ709C8 3753 aa9.1□□□□□ -0.95
MEGF6-201ENST00000294599 A0A0A0MQY5 61 aa9.07□□□□□ -0.96
MEGF6-201ENST00000294599 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.03□□□□□ -0.96
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.01□□□□□ -0.97
MEGF6-201ENST00000294599 A8MUU9 505 aa8.92□□□□□ -0.98
MEGF6-201ENST00000294599 FBN3Q75N90 2809 aa8.91□□□□□ -0.98
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.9□□□□□ -0.99
MEGF6-201ENST00000294599 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.87□□□□□ -0.99
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.86□□□□□ -0.99
MEGF6-201ENST00000294599 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -1
MEGF6-201ENST00000294599 PLAC4Q8WY50 150 aa8.81□□□□□ -1
MEGF6-201ENST00000294599 NDUFAF8A1L188 74 aa8.76□□□□□ -1.01
MEGF6-201ENST00000294599 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.76□□□□□ -1.01
MEGF6-201ENST00000294599 H0YAA0 97 aa8.68□□□□□ -1.02
MEGF6-201ENST00000294599 AKAP9Q99996 3911 aa8.62□□□□□ -1.03
MEGF6-201ENST00000294599 XP32Q5T750 250 aa8.59□□□□□ -1.03
MEGF6-201ENST00000294599 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.59□□□□□ -1.04
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.58□□□□□ -1.04
MEGF6-201ENST00000294599 COL7A1Q02388 2944 aa8.58□□□□□ -1.04
MEGF6-201ENST00000294599 TNP1P09430 55 aa8.54□□□□□ -1.04
MEGF6-201ENST00000294599 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.46□□□□□ -1.06
MEGF6-201ENST00000294599 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
MEGF6-201ENST00000294599 P0C880 135 aa8.41□□□□□ -1.06
MEGF6-201ENST00000294599 A0A1B0GVY2 172 aa8.36□□□□□ -1.07
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.35□□□□□ -1.07
MEGF6-201ENST00000294599 PP632Q6XCG6 107 aa8.35□□□□□ -1.07
MEGF6-201ENST00000294599 TPRXLQ17RH7 258 aa8.33□□□□□ -1.08
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP10-8P60410 259 aa8.31□□□□□ -1.08
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.14□□□□□ -1.11
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.1□□□□□ -1.11
MEGF6-201ENST00000294599 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP12-2P59991 146 aa8.07□□□□□ -1.12
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP10-10P60014 251 aa8.05□□□□□ -1.12
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.03□□□□□ -1.12
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8□□□□□ -1.13
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP12-1P59990 96 aa7.98□□□□□ -1.13
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.94□□□□□ -1.14
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.88□□□□□ -1.15
MEGF6-201ENST00000294599 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.85□□□□□ -1.15
MEGF6-201ENST00000294599 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.85□□□□□ -1.15
MEGF6-201ENST00000294599 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.83□□□□□ -1.16
MEGF6-201ENST00000294599 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.82□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63 ms