RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 A8MUN3 132 aa16.6■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 COA5Q86WW8 74 aa16.59■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 DNAH8Q96JB1 4490 aa16.59■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 IGLV7-43P04211 117 aa16.58■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 CD164Q04900 197 aa16.58■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 PCOTHQ58A44 107 aa16.58■□□□□ 0.25
UBP1-201ENST00000283628 ALMS1Q8TCU4 4167 aa16.54■□□□□ 0.24
UBP1-201ENST00000283628 Q5VV11 94 aa16.53■□□□□ 0.24
UBP1-201ENST00000283628 A0A087X002 238 aa16.51■□□□□ 0.23
UBP1-201ENST00000283628 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa16.51■□□□□ 0.23
UBP1-201ENST00000283628 FRAS1Q86XX4 4008 aa16.46■□□□□ 0.23
UBP1-201ENST00000283628 TGP01266 2768 aa16.46■□□□□ 0.23
UBP1-201ENST00000283628 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa16.45■□□□□ 0.22
UBP1-201ENST00000283628 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa16.44■□□□□ 0.22
UBP1-201ENST00000283628 SPINK6Q6UWN8 80 aa16.43■□□□□ 0.22
UBP1-201ENST00000283628 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa16.42■□□□□ 0.22
UBP1-201ENST00000283628 PRR15LQ9BU68 103 aa16.42■□□□□ 0.22
UBP1-201ENST00000283628 C8orf87E5RJ46 101 aa16.38■□□□□ 0.21
UBP1-201ENST00000283628 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa16.37■□□□□ 0.21
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa16.35■□□□□ 0.21
UBP1-201ENST00000283628 Q75L30 129 aa16.34■□□□□ 0.21
UBP1-201ENST00000283628 HRES1P13985 223 aa16.31■□□□□ 0.2
UBP1-201ENST00000283628 Q5W150 140 aa16.31■□□□□ 0.2
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP10-2P60368 255 aa16.3■□□□□ 0.2
UBP1-201ENST00000283628 DNAH11Q96DT5 4516 aa16.3■□□□□ 0.2
UBP1-201ENST00000283628 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa16.28■□□□□ 0.2
UBP1-201ENST00000283628 DNAH5Q8TE73 4624 aa16.23■□□□□ 0.19
UBP1-201ENST00000283628 SPAG11AQ6PDA7 123 aa16.22■□□□□ 0.19
UBP1-201ENST00000283628 LINC00313P59037 77 aa16.19■□□□□ 0.18
UBP1-201ENST00000283628 HYDINQ4G0P3 5121 aa16.18■□□□□ 0.18
UBP1-201ENST00000283628 A8MU10 97 aa16.16■□□□□ 0.18
UBP1-201ENST00000283628 Q6ZSA8 131 aa16.16■□□□□ 0.18
UBP1-201ENST00000283628 A6NED7 52 aa16.15■□□□□ 0.18
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa16.14■□□□□ 0.17
UBP1-201ENST00000283628 FAT2Q9NYQ8 4349 aa16.14■□□□□ 0.17
UBP1-201ENST00000283628 FAM229AH3BQW9 127 aa16.14■□□□□ 0.17
UBP1-201ENST00000283628 PKD1P98161 4303 aa16.13■□□□□ 0.17
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP10-1P60331 282 aa16.1■□□□□ 0.17
UBP1-201ENST00000283628 PMAIP1Q13794 54 aa16.1■□□□□ 0.17
UBP1-201ENST00000283628 ACYP2P14621 99 aa16.09■□□□□ 0.17
UBP1-201ENST00000283628 LCA10Q71F78 164 aa16.08■□□□□ 0.16
UBP1-201ENST00000283628 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa16.04■□□□□ 0.16
UBP1-201ENST00000283628 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa16.04■□□□□ 0.16
UBP1-201ENST00000283628 DMAC1Q96GE9 116 aa16.03■□□□□ 0.16
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2-30P06310 120 aa15.98■□□□□ 0.15
UBP1-201ENST00000283628 PRR26Q8N8Z3 221 aa15.98■□□□□ 0.15
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa15.98■□□□□ 0.15
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa15.98■□□□□ 0.15
UBP1-201ENST00000283628 SACSQ9NZJ4 4579 aa15.96■□□□□ 0.15
UBP1-201ENST00000283628 SPTSSBQ8NFR3 76 aa15.93■□□□□ 0.14
UBP1-201ENST00000283628 RETNLBQ9BQ08 111 aa15.9■□□□□ 0.14
UBP1-201ENST00000283628 LRP1BQ9NZR2 4599 aa15.88■□□□□ 0.13
UBP1-201ENST00000283628 SPINK7P58062 85 aa15.88■□□□□ 0.13
UBP1-201ENST00000283628 C4orf48Q5BLP8 95 aa15.84■□□□□ 0.13
UBP1-201ENST00000283628 SPINK1P00995 79 aa15.8■□□□□ 0.12
UBP1-201ENST00000283628 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP15.8■□□□□ 0.12
UBP1-201ENST00000283628 TYMSOSQ8TAI1 123 aa15.79■□□□□ 0.12
UBP1-201ENST00000283628 A6NN06 94 aa15.77■□□□□ 0.11
UBP1-201ENST00000283628 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa15.75■□□□□ 0.11
UBP1-201ENST00000283628 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa15.7■□□□□ 0.1
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GVY2 172 aa15.69■□□□□ 0.1
UBP1-201ENST00000283628 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa15.69■□□□□ 0.1
UBP1-201ENST00000283628 SEC61GP60059 68 aa15.67■□□□□ 0.1
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GU69 56 aa15.65■□□□□ 0.1
UBP1-201ENST00000283628 RPS29P62273 56 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
UBP1-201ENST00000283628 PKHD1P08F94 4074 aa15.64■□□□□ 0.09
UBP1-201ENST00000283628 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
UBP1-201ENST00000283628 C7orf65Q6ZTY9 151 aa15.59■□□□□ 0.09
UBP1-201ENST00000283628 RYR2Q92736 4967 aa15.59■□□□□ 0.09
UBP1-201ENST00000283628 LINC00304Q8N9R0 145 aa15.58■□□□□ 0.08
UBP1-201ENST00000283628 SPATA8Q6RVD6 105 aa15.45■□□□□ 0.06
UBP1-201ENST00000283628 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
UBP1-201ENST00000283628 APOBP04114 4563 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
UBP1-201ENST00000283628 UQCR11O14957 56 aa15.4■□□□□ 0.06
UBP1-201ENST00000283628 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
UBP1-201ENST00000283628 MIR22HGQ0VDD5 57 aa15.34■□□□□ 0.05
UBP1-201ENST00000283628 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa15.3■□□□□ 0.04
UBP1-201ENST00000283628 Q8N1X5 172 aa15.29■□□□□ 0.04
UBP1-201ENST00000283628 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa15.29■□□□□ 0.04
UBP1-201ENST00000283628 A8MUU9 505 aa15.28■□□□□ 0.04
UBP1-201ENST00000283628 FAT1Q14517 4588 aa15.19■□□□□ 0.02
UBP1-201ENST00000283628 C9orf92A6NGG3 77 aa15.19■□□□□ 0.02
UBP1-201ENST00000283628 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa15.14■□□□□ 0.01
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa15□□□□□ -0.01
UBP1-201ENST00000283628 RYR3Q15413 4870 aa14.99□□□□□ -0.01
UBP1-201ENST00000283628 PRAC1Q96KF2 57 aa14.93□□□□□ -0.02
UBP1-201ENST00000283628 HSPG2P98160 4391 aa14.9□□□□□ -0.02
UBP1-201ENST00000283628 ADM2Q7Z4H4 148 aa14.89□□□□□ -0.03
UBP1-201ENST00000283628 Q5VSD8 79 aa14.87□□□□□ -0.03
UBP1-201ENST00000283628 COX6B2Q6YFQ2 88 aa14.82□□□□□ -0.04
UBP1-201ENST00000283628 H0YAA0 97 aa14.81□□□□□ -0.04
UBP1-201ENST00000283628 RYR1P21817 5038 aa14.81□□□□□ -0.04
UBP1-201ENST00000283628 A0A1B0GU33 70 aa14.78□□□□□ -0.04
UBP1-201ENST00000283628 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP10-8P60410 259 aa14.74□□□□□ -0.05
UBP1-201ENST00000283628 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa14.73□□□□□ -0.05
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.71□□□□□ -0.05
UBP1-201ENST00000283628 TNXBP22105 4242 aa14.68□□□□□ -0.06
UBP1-201ENST00000283628 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 111.3 ms