RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000018482.12

Tnip1-201, Transcript of TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tnip1, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tln2Q71LX4 2375 aa9.15□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ighv7-2A0A0A6YX91 119 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm20481G3UXK4 153 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm6871L7N248 545 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 3100002H09RikQ9CXW6 140 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Map1aQ9QYR6 2776 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Igkv1-131A0A140T8M8 120 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Defa16P50714 93 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 H2-M10.4Q85ZW8 331 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Olfr1243Q8VGM7 305 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Actl6bQ99MR0 426 aa9.14□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 1700003H04RikE9PXM2 192 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 P01788 123 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tff3Q62395 81 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ighv9-2A0A0B4J1J4 117 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tmem141A2AJB2 108 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Iqcf6G3UWF2 157 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Smim19Q80ZU4 107 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Slamf7Q8BHK6 333 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rs1Q9Z1L4 224 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm28778A0A087WSK7 233 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cldn34c3J3QJW5 233 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cldn34c2J3QNM1 233 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Mef2bO55087 349 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 P01787 123 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tdgf1P51865 171 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Atp5g2P56383 146 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 MdfiP70331 251 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ubald1Q6P3B2 176 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cldn34c1Q8K193 234 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Q9CQM1 111 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tomm6Q9CQN3 74 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ccl28Q9JIL2 130 aa9.13□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 DscamQ9ERC8 2013 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Zfp950A0A0U1RQ46 609 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Cd209gD3Z5D4 194 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Fam3dP97805 223 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Arrdc5Q497K5 325 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gng5Q80SZ7 68 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 PgpQ8CHP8 321 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ncoa6Q9JL19 2067 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Edn2P22389 175 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Vma21Q78T54 101 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Q8VC23 124 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Pxmp4Q9JJW0 212 aa9.12□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ighv1-26A0A075B5V0 117 aa9.11□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Trav14n-3A0A075B645 120 aa9.11□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm29644A0A087WPG2 191 aa9.11□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm17359A0A0G2JEB7 487 aa9.11□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ly6c1P0CW02 131 aa9.11□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 AsipQ03288 131 aa9.11□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Wfdc8Q4KUS1 273 aa9.11□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 PolP10400 120 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 TgfaP48030 159 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ube2d2bQ6ZWY6 147 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Pradc1Q9D9N8 188 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Trav14-3A0A075B607 120 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 1700084M14RikB1AT01 78 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Zfp874aQ8BX23 447 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Olfr481Q8VGI5 312 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Tmed6Q9CQG0 239 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Slc25a15Q9WVD5 301 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Hcfc1Q61191 2045 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 SetxA2AKX3 2646 aa9.1□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ighv14-1A0A075B5R4 117 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Smim10l1A0A087WNQ7 89 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm20825J3QM67 227 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 P01806 116 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rbp4Q00724 201 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Ssty2Q149W4 227 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm21394Q497R7 227 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 MiaQ61865 130 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm20854Q62461 227 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 EpopQ7TNS8 369 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Prr30Q9D9B7 401 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Dkk2Q9QYZ8 259 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Igkv19-93A0A0G2JFZ3 115 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Wt1P22561 449 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Atp5eP56382 52 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Trav7-2Q5R1I3 112 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Abca7Q91V24 2159 aa9.09□□□□□ -0.95
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Trbv31A0A075B5J5 111 aa9.09□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm45623A0A1B0GSF6 103 aa9.09□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rom1P32958 351 aa9.09□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Folr2Q05685 251 aa9.09□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm5464Q3UY29 175 aa9.09□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Trank1Q8BV79 2999 aa9.09□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Dpm2Q9Z324 84 aa9.09□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Dscaml1Q4VA61 2053 aa9.08□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Lama5Q61001 3718 aa9.08□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Zfp493E9Q1L8 384 aa9.08□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Rnase9P60154 184 aa9.08□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Znrd1Q791N7 123 aa9.08□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Olfr365Q8VFT2 312 aa9.08□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Gm3618D3Z4P5 127 aa9.08□□□□□ -0.96
Tnip1-201ENSMUST00000018482 Lyz1P17897 148 aa9.08□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.9 ms