RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636065.1

KCNQ2-223, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 2, human

TSL 5

Gene KCNQ2, Length 145 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KCNQ2-223	ENST00000636065	CD164	Q04900	197 aa		5	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		5	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065		A6NED7	52 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.99	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.98	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065		A0A1W2PNN7	141 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.97	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	MTOR	P42345	2549 aa		4.97	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		4.96	□□□□□ -1.61
KCNQ2-223	ENST00000636065	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	NF1	P21359	2839 aa		4.96	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	PDZD2	O15018	2839 aa		4.95	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065		Q6ZR54	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065		A0A1B0GVX0	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.92	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	ACAN	P16112	2415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	HIVEP1	P15822	2718 aa		4.9	□□□□□ -1.62
KCNQ2-223	ENST00000636065	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		4.9	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065		A6NN06	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	LCA10	Q71F78	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065		Q96NJ1	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.87	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	HRES1	P13985	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	VWF	P04275	2813 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065		K7EIL1	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	ACYP2	P14621	99 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.84	□□□□□ -1.63
KCNQ2-223	ENST00000636065	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065		A8MU10	97 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	MDFI	Q99750	246 aa		4.83	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	FASN	P49327	2511 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	CUBN	O60494	3623 aa		4.82	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.81	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	SPINK7	P58062	85 aa		4.79	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	ZNF861P	O60384	105 aa		4.78	□□□□□ -1.64
KCNQ2-223	ENST00000636065	ATR	Q13535	2644 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.77	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.76	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065		A0A087X002	238 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065		A0A1B0GU69	56 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	PANO1	I0J062	215 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	RTL8C	O15255	209 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.75	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065		A0A087WTM6	91 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.74	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.73	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065		Q5W150	140 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.72	□□□□□ -1.65
KCNQ2-223	ENST00000636065	LINC00313	P59037	77 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KCNQ2-223	ENST00000636065	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.71	□□□□□ -1.66
KCNQ2-223	ENST00000636065	UQCR11	O14957	56 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KCNQ2-223	ENST00000636065	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KCNQ2-223	ENST00000636065	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.7	□□□□□ -1.66
KCNQ2-223	ENST00000636065	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.7	□□□□□ -1.66

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