RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615445.4

PTPRJ-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRJ, Length 4,773 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-208ENST00000615445 A0A1B0GVX0 72 aa13.19□□□□□ -0.3
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PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa12.19□□□□□ -0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa12.18□□□□□ -0.46
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PTPRJ-208ENST00000615445 Q5XG85 94 aa12.16□□□□□ -0.46
PTPRJ-208ENST00000615445 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
PTPRJ-208ENST00000615445 MXRA5Q9NR99 2828 aa12.1□□□□□ -0.47
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