RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611415.4

TNS1-220, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNS1, Length 6,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
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TNS1-220ENST00000611415 KRTAP10-1P60331 282 aa7.04□□□□□ -1.28
TNS1-220ENST00000611415 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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TNS1-220ENST00000611415 M0QZ58 72 aa7.01□□□□□ -1.29
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP10-2P60368 255 aa7.01□□□□□ -1.29
TNS1-220ENST00000611415 Q5VSD8 79 aa7.01□□□□□ -1.29
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TNS1-220ENST00000611415 PANO1I0J062 215 aa6.98□□□□□ -1.29
TNS1-220ENST00000611415 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.98□□□□□ -1.29
TNS1-220ENST00000611415 A0A087X002 238 aa6.93□□□□□ -1.3
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TNS1-220ENST00000611415 A6NN06 94 aa6.9□□□□□ -1.3
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TNS1-220ENST00000611415 CHD9Q3L8U1 2897 aa6.89□□□□□ -1.31
TNS1-220ENST00000611415 UTRNP46939 3433 aa6.88□□□□□ -1.31
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TNS1-220ENST00000611415 C5orf42Q9H799 3197 aa6.87□□□□□ -1.31
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TNS1-220ENST00000611415 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.86□□□□□ -1.31
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.86□□□□□ -1.31
TNS1-220ENST00000611415 CHD7Q9P2D1 2997 aa6.84□□□□□ -1.31
TNS1-220ENST00000611415 A8MU10 97 aa6.83□□□□□ -1.32
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TNS1-220ENST00000611415 TRANK1O15050 2925 aa6.81□□□□□ -1.32
TNS1-220ENST00000611415 ITPR3Q14573 2671 aa6.81□□□□□ -1.32
TNS1-220ENST00000611415 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.8□□□□□ -1.32
TNS1-220ENST00000611415 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.8□□□□□ -1.32
TNS1-220ENST00000611415 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.78□□□□□ -1.32
TNS1-220ENST00000611415 HTTP42858 3142 aa6.77□□□□□ -1.33
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TNS1-220ENST00000611415 CEP350Q5VT06 3117 aa6.75□□□□□ -1.33
TNS1-220ENST00000611415 NDUFAF8A1L188 74 aa6.74□□□□□ -1.33
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.73□□□□□ -1.33
TNS1-220ENST00000611415 A8MUU9 505 aa6.73□□□□□ -1.33
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.71□□□□□ -1.34
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TNS1-220ENST00000611415 A0A0C4DFX4 3053 aa6.7□□□□□ -1.34
TNS1-220ENST00000611415 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.67□□□□□ -1.34
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.62□□□□□ -1.35
TNS1-220ENST00000611415 CFAP54Q96N23 3096 aa6.62□□□□□ -1.35
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TNS1-220ENST00000611415 ZNF292O60281 2723 aa6.58□□□□□ -1.36
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TNS1-220ENST00000611415 CHD6Q8TD26 2715 aa6.52□□□□□ -1.37
TNS1-220ENST00000611415 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.49□□□□□ -1.37
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TNS1-220ENST00000611415 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.48□□□□□ -1.37
TNS1-220ENST00000611415 MGAQ8IWI9 3026 aa6.48□□□□□ -1.37
TNS1-220ENST00000611415 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TNS1-220ENST00000611415 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
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TNS1-220ENST00000611415 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.43□□□□□ -1.38
TNS1-220ENST00000611415 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
TNS1-220ENST00000611415 CENPEQ02224 2701 aa6.41□□□□□ -1.38
TNS1-220ENST00000611415 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.4□□□□□ -1.38
TNS1-220ENST00000611415 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.4□□□□□ -1.39
TNS1-220ENST00000611415 TRIOO75962 3097 aa6.39□□□□□ -1.39
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TNS1-220ENST00000611415 H0YAA0 97 aa6.37□□□□□ -1.39
TNS1-220ENST00000611415 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.36□□□□□ -1.39
TNS1-220ENST00000611415 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.34□□□□□ -1.39
TNS1-220ENST00000611415 STAB1Q9NY15 2570 aa6.34□□□□□ -1.39
TNS1-220ENST00000611415 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.34□□□□□ -1.39
TNS1-220ENST00000611415 XP32Q5T750 250 aa6.33□□□□□ -1.4
TNS1-220ENST00000611415 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
TNS1-220ENST00000611415 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.31□□□□□ -1.4
TNS1-220ENST00000611415 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.3□□□□□ -1.4
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TNS1-220ENST00000611415 LAMA3Q16787 3333 aa6.27□□□□□ -1.41
TNS1-220ENST00000611415 FRYQ5TBA9 3013 aa6.27□□□□□ -1.41
TNS1-220ENST00000611415 P0C880 135 aa6.27□□□□□ -1.41
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TNS1-220ENST00000611415 NOTCH1P46531 2555 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-220ENST00000611415 ITPR2Q14571 2701 aa6.19□□□□□ -1.42
TNS1-220ENST00000611415 KALRNO60229 2985 aa6.17□□□□□ -1.42
TNS1-220ENST00000611415 TPRXLQ17RH7 258 aa6.16□□□□□ -1.42
TNS1-220ENST00000611415 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.15□□□□□ -1.42
TNS1-220ENST00000611415 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.15□□□□□ -1.42
TNS1-220ENST00000611415 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
TNS1-220ENST00000611415 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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