RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 ABCC1P33527 1531 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa-0.33□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 CUBNO60494 3623 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 H0YGG7 62 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB121Q5J5C9 76 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 ST20Q9HBF5 79 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 CREBBPQ92793 2442 aa-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
RNU6-87P-201ENST00000607561 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 AKAP9Q99996 3911 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 ABCA8O94911 1581 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 VPS13DQ5THJ4 4388 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 UMAD1C9J7I0 102 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 IFI6P09912 130 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 C3orf79P0CE67 100 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRO3102Q9H379 93 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 TJP1Q07157 1748 aa-0.35□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH3Q8TD57 4116 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 TGP01266 2768 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAP3K1Q13233 1512 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC00158P58513 81 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 NREPQ16612 68 aa-0.36□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 HTTP42858 3142 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 NDUFA4O00483 81 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 ADIRFQ15847 76 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 FAT1Q14517 4588 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 USH2AO75445 5202 aa-0.37□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCRIBQ14160 1630 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZZEF1O43149 2961 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 H3BUT2 72 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 MT1AP04731 61 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 S100A13Q99584 98 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 MUC17Q685J3 4493 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 SMIM13P0DJ93 91 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.39□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 NF1P21359 2839 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 HFM1A2PYH4 1435 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 HERC2O95714 4834 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 NEBP20929 6669 aa-0.4□□□□□ -2.47
RNU6-87P-201ENST00000607561 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 A0A087WXM4 84 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 H3BNG1 76 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.41□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 IAPPP10997 89 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 PRLHP81277 87 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 DEFA5Q01523 94 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-0.42□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 BPTFQ12830 3046 aa-0.43□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 MT4P47944 62 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 C3P01024 1663 aa-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.44□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 HIVEP1P15822 2718 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 TACC2O95359 2948 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 DIP2AQ14689 1571 aa-0.45□□□□□ -2.48
RNU6-87P-201ENST00000607561 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.45□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 141.8 ms