RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF815P	A8K554	130 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	C3orf79	P0CE67	100 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SPATA45	Q537H7	98 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	SSPO	A2VEC9	5147 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GWB2	263 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTDAP	P60985	99 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC01545	Q5VT33	79 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	USH2A	O75445	5202 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	PET117	Q6UWS5	81 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338		A6NDN8	102 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	TCL1B	O95988	128 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	UBE2V1	Q13404	147 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6Q795	121 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338		A4D1N5	150 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	BATF	Q16520	125 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338		Q75L30	129 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	PCP2	Q8IVA1	136 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	IFITM1	P13164	125 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	6.14	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338		F8WEM9	126 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	IGFL1	Q6UW32	110 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	CLEC2B	Q92478	149 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	COPS9	Q8WXC6	57 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	CFC1	P0CG37	223 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	COX8A	P10176	69 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZQY7	126 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6ZVH6	145 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	6.1	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	TAX1BP3	O14907	124 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338		Q6JHZ5	121 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	LINC00575	Q6W349	94 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	ATOH7	Q8N100	152 aa		6.1	□□□□□ -1.43
TTLL3-233	ENST00000602338	PCP4	P48539	62 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	VAMP3	Q15836	100 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338		Q96NJ1	140 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	hADV29S1	A0JD25	119 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	MT2A	P02795	61 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		6.06	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338		H3BUT2	72 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338		K7ERU9	68 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	HSD52	Q0P140	79 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	HIGD1B	Q9P298	99 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	C9orf118	A6NHY6	69 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MUU9	505 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	LST1	O00453	97 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	LCE2B	O14633	110 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTLL3-233	ENST00000602338	MT1F	P04733	61 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP19-1	Q8IUB9	90 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338		K7EP34	96 aa		6	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PPM0	123 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	DSCR10	P59022	87 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS25	Q9BRG1	176 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TTLL3-233	ENST00000602338	FABP2	P12104	132 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WSZ3	146 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SCGB1A1	P11684	91 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.94	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	TEN1	Q86WV5	123 aa		5.94	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		5.94	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338		F8W1H4	67 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM236C	P0DP71	79 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	HRES1	P13985	223 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		5.93	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	KRTAP10-10	P60014	251 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	CEND1	Q8N111	149 aa		5.92	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338		J3QR89	54 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	SIGMAR1	Q99720	223 aa		5.91	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.46
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PNM2	257 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	FXYD2	P54710	66 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		5.88	□□□□□ -1.47
TTLL3-233	ENST00000602338	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.88	□□□□□ -1.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.2 ms