RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZQT0 140 aa5.27□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZQY7 126 aa5.27□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 SERP2Q8N6R1 65 aa5.27□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 C15orf56Q8N910 161 aa5.27□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.27□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.26□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.25□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 SLPIP03973 132 aa5.25□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZRU5 148 aa5.25□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 B5MCH6 92 aa5.24□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.24□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 PRR3P79522 188 aaKnown RBP5.24□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 Q8N3U1 123 aa5.24□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.23□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 USP17L23D6RBM5 183 aa5.23□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 TMEM258P61165 79 aa5.23□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.23□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.23□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.22□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 MT1HL1P0DM35 61 aa5.22□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.22□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP10-1P60331 282 aa5.22□□□□□ -1.57
GGA3-218ENST00000584243 CCDC179H3BU77 68 aa5.21□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZRP5 223 aa5.21□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.2□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.2□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 NDUFC1O43677 76 aa5.2□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 SPRR1AP35321 89 aa5.2□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZRX8 168 aa5.2□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 Q8NDZ9 215 aa5.2□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.2□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.19□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 Q6ZVQ6 151 aa5.19□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.19□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.18□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 ERC2-IT1O76042 136 aa5.18□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.17□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 F8WEM9 126 aa5.17□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 C7orf33Q8WU49 177 aa5.17□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 J3KT08 172 aa5.16□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 NREPQ16612 68 aa5.16□□□□□ -1.58
GGA3-218ENST00000584243 H0Y9J4 135 aa5.15□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.15□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 SSPOA2VEC9 5147 aa5.15□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 PSCAO43653 123 aa5.14□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 REG3GQ6UW15 175 aa5.14□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 SVIPQ8NHG7 77 aa5.14□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 KLKP1Q107X0 134 aa5.13□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.13□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 A0A0U1RQV1 116 aa5.12□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 BPY2O14599 106 aa5.12□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 Q8NBF4 154 aa5.12□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 SPRR4Q96PI1 79 aa5.12□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 A0A087WVE0 104 aa5.11□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.1□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.1□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 UBE2BP63146 152 aa5.1□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 C1orf137Q5JT78 98 aa5.1□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 Q8N377 158 aa5.1□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.09□□□□□ -1.59
GGA3-218ENST00000584243 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 Q9BRP9 147 aa5.07□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 SPRR1BP22528 89 aa5.06□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.06□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.05□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 FAM236CP0DP71 79 aa5.05□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 C20orf197Q8N268 126 aa5.05□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.05□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.05□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 IGKV4-1P06312 121 aa5.04□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.04□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 NDUFB1O75438 58 aa5.03□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.03□□□□□ -1.6
GGA3-218ENST00000584243 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 A0A096LNI7 61 aa5.02□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.02□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 DPH3Q96FX2 82 aa5.02□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 USH2AO75445 5202 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 NEBP20929 6669 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 A0A1W2PNM2 257 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 FAM168BA1KXE4 195 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 H3BPC8 53 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 H3BS24 57 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 H7BZZ5 65 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 UBE2AP49459 152 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 C5orf47Q569G3 176 aa5.01□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5□□□□□ -1.61
GGA3-218ENST00000584243 OCR1Q9BZK8 76 aa5□□□□□ -1.61
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