RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 A0A1W2PNM2 257 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 RGS21Q2M5E4 152 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 Q5BKY6 102 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM7Q9BQ49 75 aa2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 C20orf202A1L168 122 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM238C9JI98 176 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 D6R8Y8 96 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 RAB14P61106 215 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 PRELID3AQ96N28 172 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.64□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 SSPOA2VEC9 5147 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 IGIPA6NJ69 53 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 Q8N8P6 123 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 ERG28Q9UKR5 140 aa2.63□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 NPYP01303 97 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 Q6Q795 121 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 SPRR1AP35321 89 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 Q5XG85 94 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 V9GYV3 84 aa2.61□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 C9orf92A6NGG3 77 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 LINC00158P58513 81 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 TOMM6Q96B49 74 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.6□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 TCL1BO95988 128 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZRX8 168 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 PRO1933Q9H354 126 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 CST9LQ9H4G1 147 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 NAT8Q9UHE5 227 aa2.59□□□□□ -1.99
PTPRM-208ENST00000578600 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 H7C2G1 150 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.58□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 IFITM2Q01629 132 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 FABP9Q0Z7S8 132 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 USH2AO75445 5202 aa2.58□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 H3BPC8 53 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 SPINK8P0C7L1 97 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 AKR1D1P51857 326 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 ADIRFQ15847 76 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP2.57□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 PP632Q6XCG6 107 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.57□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 NEBP20929 6669 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF815PA8K554 130 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 IGLC3P0DOY3 106 aa2.55□□□□□ -2
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PTPRM-208ENST00000578600 PEA15Q15121 130 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRM-208ENST00000578600 MT-ND4LP03901 98 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 MEIG1Q5JSS6 88 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 BATF3Q9NR55 127 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 SMCO4Q9NRQ5 59 aa2.54□□□□□ -2
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PTPRM-208ENST00000578600 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRM-208ENST00000578600 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 NCR3O14931 201 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFC2O95298 119 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 SRP19P09132 144 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 FAM236CP0DP71 79 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 NDUFA6P56556 154 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 PMAIP1Q13794 54 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRM-208ENST00000578600 TMEM170BQ5T4T1 132 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRM-208ENST00000578600 Q9BRP9 147 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-208ENST00000578600 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.52□□□□□ -2.01
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PTPRM-208ENST00000578600 TCTE3Q8IZS6 198 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRM-208ENST00000578600 LINC01546A6NGU7 62 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRM-208ENST00000578600 C11orf86A6NJI1 115 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRM-208ENST00000578600 LST1O00453 97 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRM-208ENST00000578600 KRTAP5-9P26371 169 aa2.51□□□□□ -2.01
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PTPRM-208ENST00000578600 MT2AP02795 61 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRM-208ENST00000578600 SMIM13P0DJ93 91 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRM-208ENST00000578600 ADCYAP1P18509 176 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRM-208ENST00000578600 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.5□□□□□ -2.01
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