RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
PTPRM-205ENST00000577827 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 CDH23Q9H251 3354 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 HRES1P13985 223 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 XIRP2A4UGR9 3374 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 H3BS24 57 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 LAMA1P25391 3075 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 LCE6AA0A183 80 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 MAST4O15021 2626 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRM-205ENST00000577827 VCANP13611 3396 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZR54 194 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01554Q52M75 96 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH14Q0VDD8 3507 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 SPINK7P58062 85 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 KALRNO60229 2985 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 Q8N1X5 172 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 CRIPTQ9P021 101 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 TEX15Q9BXT5 2789 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 Q5W150 140 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRM-205ENST00000577827 SZT2Q5T011 3432 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00483Q53H64 154 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 DMAC1Q96GE9 116 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1B0GU33 70 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 C9orf92A6NGG3 77 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 REV3LO60673 3130 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 PRAC1Q96KF2 57 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 FREM2Q5SZK8 3169 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRM-205ENST00000577827 FRYLO94915 3013 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 NOTCH1P46531 2555 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 FLNCQ14315 2725 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 ITPR1Q14643 2758 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 ATMQ13315 3056 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 A6NN06 94 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 LRBAP50851 2863 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 CSAG1Q6PB30 78 aa6.15□□□□□ -1.42
PTPRM-205ENST00000577827 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 TACC2O95359 2948 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 EYSQ5T1H1 3165 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0D9SG42 100 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 COL6A5A8TX70 2615 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 PANO1I0J062 215 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 STAB1Q9NY15 2570 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 ZZEF1O43149 2961 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-205ENST00000577827 COL6A3P12111 3177 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-205ENST00000577827 COL12A1Q99715 3063 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRM-205ENST00000577827 A0A087X002 238 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-205ENST00000577827 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRM-205ENST00000577827 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-205ENST00000577827 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRM-205ENST00000577827 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRM-205ENST00000577827 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 A8MU10 97 aa6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 ITPR2Q14571 2701 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 SPEGQ15772 3267 aa6□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 APCP25054 2843 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 ROMO1P60602 79 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 ZANQ9Y493 2812 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 S4R3F8 94 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRM-205ENST00000577827 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP10-1P60331 282 aa5.95□□□□□ -1.46
PTPRM-205ENST00000577827 LUZP6Q538Z0 58 aa5.95□□□□□ -1.46
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