RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576635.6

SPNS2-208, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

TSL 3

Gene SPNS2, Length 901 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-208ENST00000576635 PCP2Q8IVA1 136 aa7.99□□□□□ -1.13
SPNS2-208ENST00000576635 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.98□□□□□ -1.13
SPNS2-208ENST00000576635 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.98□□□□□ -1.13
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.98□□□□□ -1.13
SPNS2-208ENST00000576635 CFC1P0CG37 223 aa7.97□□□□□ -1.13
SPNS2-208ENST00000576635 Q75L30 129 aa7.97□□□□□ -1.13
SPNS2-208ENST00000576635 SSPOA2VEC9 5147 aa7.97□□□□□ -1.13
SPNS2-208ENST00000576635 A4D1N5 150 aa7.96□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 SCGB1D1O95968 90 aa7.96□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 F8WEM9 126 aa7.95□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.95□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 USH2AO75445 5202 aa7.94□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 PYY3Q5JQD4 70 aa7.94□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.93□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 IFITM1P13164 125 aa7.93□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.93□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 COPS9Q8WXC6 57 aa7.93□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 IGFL1Q6UW32 110 aa7.91□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 CLEC2BQ92478 149 aa7.91□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 Q6JHZ5 121 aa7.9□□□□□ -1.14
SPNS2-208ENST00000576635 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.88□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 Q6ZVH6 145 aa7.88□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.87□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00575Q6W349 94 aa7.87□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 Q6ZQY7 126 aa7.87□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 Q96NJ1 140 aa7.87□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.87□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.86□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 SPATA45Q537H7 98 aa7.86□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 COX8AP10176 69 aa7.85□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.85□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 VAMP8Q9BV40 100 aa7.85□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 MT2AP02795 61 aa7.84□□□□□ -1.15
SPNS2-208ENST00000576635 hADV29S1A0JD25 119 aa7.83□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 VAMP3Q15836 100 aa7.83□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 C14orf144Q96I85 54 aa7.83□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.83□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.83□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 LST1O00453 97 aa7.82□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.82□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.81□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 A8MUU9 505 aa7.81□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 DLEU1O43261 78 aa7.81□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.81□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 LCE2BO14633 110 aa7.8□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 H3BUT2 72 aa7.79□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 MT1FP04733 61 aa7.78□□□□□ -1.16
SPNS2-208ENST00000576635 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 SMIM6P0DI80 62 aa7.75□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.75□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.74□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.74□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 HIGD1BQ9P298 99 aa7.74□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.74□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.72□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.72□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 FAM236CP0DP71 79 aa7.72□□□□□ -1.17
SPNS2-208ENST00000576635 DSCR10P59022 87 aa7.71□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP10-10P60014 251 aa7.71□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 HIST1H4GQ99525 98 aa7.69□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 A0A087WSZ3 146 aa7.68□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.68□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 TEN1Q86WV5 123 aa7.68□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 C12orf57Q99622 126 aa7.68□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.68□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 HRES1P13985 223 aa7.66□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 FXYD2P54710 66 aa7.66□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.66□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 CEND1Q8N111 149 aa7.65□□□□□ -1.18
SPNS2-208ENST00000576635 HSD52Q0P140 79 aa7.63□□□□□ -1.19
SPNS2-208ENST00000576635 SIGMAR1Q99720 223 aa7.63□□□□□ -1.19
SPNS2-208ENST00000576635 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.63□□□□□ -1.19
SPNS2-208ENST00000576635 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00313P59037 77 aa7.6□□□□□ -1.19
SPNS2-208ENST00000576635 A0A0B4J2C4 111 aa7.59□□□□□ -1.19
SPNS2-208ENST00000576635 K7ERJ3 54 aa7.58□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.58□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.58□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 H3BMG7 143 aa7.57□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.57□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 A0A1W2PNM2 257 aa7.56□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 IGKV4-1P06312 121 aa7.55□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 TSTD3H0UI37 97 aa7.54□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 SNCGO76070 127 aa7.54□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 RAB37Q96AX2 223 aa7.54□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 LINC00846Q9NV44 126 aa7.54□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.53□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 A6NJY4 79 aa7.53□□□□□ -1.2
SPNS2-208ENST00000576635 H0YGX0 51 aa7.52□□□□□ -1.21
SPNS2-208ENST00000576635 FABP2P12104 132 aa7.52□□□□□ -1.21
SPNS2-208ENST00000576635 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.52□□□□□ -1.21
SPNS2-208ENST00000576635 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.5□□□□□ -1.21
SPNS2-208ENST00000576635 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.48□□□□□ -1.21
SPNS2-208ENST00000576635 TRIAP1O43715 76 aa7.48□□□□□ -1.21
SPNS2-208ENST00000576635 MTURNQ8N3F0 131 aa7.47□□□□□ -1.21
SPNS2-208ENST00000576635 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.4 ms