RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565922.1

CMTM3-211, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM3, Length 615 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3-211ENST00000565922 SNCGO76070 127 aa11.09□□□□□ -0.63
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CMTM3-211ENST00000565922 Q5XG85 94 aa11.07□□□□□ -0.64
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CMTM3-211ENST00000565922 MUC17Q685J3 4493 aa11.04□□□□□ -0.64
CMTM3-211ENST00000565922 H0YGX0 51 aa11.04□□□□□ -0.64
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CMTM3-211ENST00000565922 K7ERJ3 54 aa10.82□□□□□ -0.68
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CMTM3-211ENST00000565922 Q6Q795 121 aa10.82□□□□□ -0.68
CMTM3-211ENST00000565922 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.82□□□□□ -0.68
CMTM3-211ENST00000565922 H3BMG7 143 aa10.8□□□□□ -0.68
CMTM3-211ENST00000565922 TEN1Q86WV5 123 aa10.8□□□□□ -0.68
CMTM3-211ENST00000565922 ORMDL1Q9P0S3 153 aa10.79□□□□□ -0.68
CMTM3-211ENST00000565922 LST1O00453 97 aa10.78□□□□□ -0.68
CMTM3-211ENST00000565922 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa10.75□□□□□ -0.69
CMTM3-211ENST00000565922 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa10.75□□□□□ -0.69
CMTM3-211ENST00000565922 FAT4Q6V0I7 4981 aa10.74□□□□□ -0.69
CMTM3-211ENST00000565922 PCOTHQ58A44 107 aa10.74□□□□□ -0.69
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CMTM3-211ENST00000565922 SCGB1C2P0DMR2 95 aa10.71□□□□□ -0.69
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CMTM3-211ENST00000565922 A0A087WSZ3 146 aa10.7□□□□□ -0.7
CMTM3-211ENST00000565922 M0R143 59 aa10.7□□□□□ -0.7
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CMTM3-211ENST00000565922 A0A1B0GV72 72 aa10.61□□□□□ -0.71
CMTM3-211ENST00000565922 TSTD3H0UI37 97 aa10.59□□□□□ -0.71
CMTM3-211ENST00000565922 Q75L30 129 aa10.59□□□□□ -0.71
CMTM3-211ENST00000565922 CCKP06307 115 aa10.58□□□□□ -0.72
CMTM3-211ENST00000565922 Q96NJ1 140 aa10.58□□□□□ -0.72
CMTM3-211ENST00000565922 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CMTM3-211ENST00000565922 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.56□□□□□ -0.72
CMTM3-211ENST00000565922 ATXN8Q156A1 80 aa10.55□□□□□ -0.72
CMTM3-211ENST00000565922 DSCR8Q96T75 97 aa10.55□□□□□ -0.72
CMTM3-211ENST00000565922 SIGMAR1Q99720 223 aa10.55□□□□□ -0.72
CMTM3-211ENST00000565922 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.53□□□□□ -0.72
CMTM3-211ENST00000565922 LYRM7Q5U5X0 104 aa10.53□□□□□ -0.72
CMTM3-211ENST00000565922 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.51□□□□□ -0.73
CMTM3-211ENST00000565922 IGKV4-1P06312 121 aa10.5□□□□□ -0.73
CMTM3-211ENST00000565922 VPS25Q9BRG1 176 aa10.5□□□□□ -0.73
CMTM3-211ENST00000565922 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.49□□□□□ -0.73
CMTM3-211ENST00000565922 C9JAW5 83 aa10.48□□□□□ -0.73
CMTM3-211ENST00000565922 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
CMTM3-211ENST00000565922 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.46□□□□□ -0.73
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CMTM3-211ENST00000565922 LCE2CQ5TA81 110 aa10.46□□□□□ -0.73
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CMTM3-211ENST00000565922 DSCR10P59022 87 aa10.45□□□□□ -0.74
CMTM3-211ENST00000565922 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa10.44□□□□□ -0.74
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CMTM3-211ENST00000565922 BATFQ16520 125 aa10.44□□□□□ -0.74
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CMTM3-211ENST00000565922 A0A1B0GW54 56 aa10.39□□□□□ -0.75
CMTM3-211ENST00000565922 J3KT08 172 aa10.37□□□□□ -0.75
CMTM3-211ENST00000565922 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa10.37□□□□□ -0.75
CMTM3-211ENST00000565922 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.36□□□□□ -0.75
CMTM3-211ENST00000565922 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.36□□□□□ -0.75
CMTM3-211ENST00000565922 MT1HP80294 61 aa10.36□□□□□ -0.75
CMTM3-211ENST00000565922 C8orf87E5RJ46 101 aa10.35□□□□□ -0.75
CMTM3-211ENST00000565922 Q6ZQT0 140 aa10.35□□□□□ -0.75
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