RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560937.1

MFGE8-214, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 801 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-214ENST00000560937 MYCBP2O75592 4640 aa10.7□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 Q8N377 158 aa10.69□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 MOBPQ13875 183 aa10.68□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 LST1O00453 97 aa10.67□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 OCIAD2Q56VL3 154 aa10.67□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 TCL1BO95988 128 aa10.65□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 TRACP01848 142 aa10.65□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 ATXN8Q156A1 80 aa10.65□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 ORMDL1Q9P0S3 153 aa10.65□□□□□ -0.7
MFGE8-214ENST00000560937 F8WEM9 126 aa10.64□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 Q8NBF4 154 aa10.64□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 PPDPFLQ8WWR9 84 aa10.64□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 A0A1W2PPM0 123 aa10.63□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 GHRHP01286 108 aa10.63□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 SMIM29Q86T20 159 aa10.63□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 FABP2P12104 132 aa10.62□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa10.6□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.6□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.59□□□□□ -0.71
MFGE8-214ENST00000560937 TNXBP22105 4242 aa10.58□□□□□ -0.72
MFGE8-214ENST00000560937 H3BQ85 93 aa10.58□□□□□ -0.72
MFGE8-214ENST00000560937 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa10.56□□□□□ -0.72
MFGE8-214ENST00000560937 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
MFGE8-214ENST00000560937 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.56□□□□□ -0.72
MFGE8-214ENST00000560937 SPCS1Q9Y6A9 102 aa10.55□□□□□ -0.72
MFGE8-214ENST00000560937 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
MFGE8-214ENST00000560937 C9JAW5 83 aa10.53□□□□□ -0.72
MFGE8-214ENST00000560937 BAALC-AS2P0C853 105 aa10.53□□□□□ -0.72
MFGE8-214ENST00000560937 A0A1B0GV72 72 aa10.52□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.51□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.51□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 A0A0G2JQZ4 141 aa10.5□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 H3BMG7 143 aa10.5□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 Q6JHZ5 121 aa10.5□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa10.49□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 UBE2V1Q13404 147 aa10.49□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 IGFL1Q6UW32 110 aa10.48□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 MTURNQ8N3F0 131 aa10.48□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 ANKRD29Q8N6D5 301 aa10.48□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 K7EP34 96 aa10.46□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 SPINK1P00995 79 aa10.46□□□□□ -0.73
MFGE8-214ENST00000560937 CD164Q04900 197 aa10.43□□□□□ -0.74
MFGE8-214ENST00000560937 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa10.43□□□□□ -0.74
MFGE8-214ENST00000560937 H3BT86 120 aa10.42□□□□□ -0.74
MFGE8-214ENST00000560937 RBM3P98179 157 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
MFGE8-214ENST00000560937 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
MFGE8-214ENST00000560937 LIMD2Q9BT23 127 aa10.39□□□□□ -0.75
MFGE8-214ENST00000560937 DSCR8Q96T75 97 aa10.38□□□□□ -0.75
MFGE8-214ENST00000560937 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.38□□□□□ -0.75
MFGE8-214ENST00000560937 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa10.37□□□□□ -0.75
MFGE8-214ENST00000560937 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa10.35□□□□□ -0.75
MFGE8-214ENST00000560937 TEN1Q86WV5 123 aa10.35□□□□□ -0.75
MFGE8-214ENST00000560937 VPS25Q9BRG1 176 aa10.34□□□□□ -0.75
MFGE8-214ENST00000560937 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa10.33□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 CCKP06307 115 aa10.33□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 PRR4Q16378 134 aa10.33□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 A0A1W2PNM2 257 aa10.32□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 Q6Q795 121 aa10.32□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 C14orf132Q9NPU4 83 aa10.32□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 PRO0461Q9UI25 63 aa10.31□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 A0A1B0GV90 55 aa10.29□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 A0A087WSZ3 146 aa10.28□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa10.28□□□□□ -0.76
MFGE8-214ENST00000560937 Q5XG85 94 aa10.27□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 Q6ZQT0 140 aa10.27□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa10.26□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 F8W1H4 67 aa10.26□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 PDE6GP18545 87 aa10.26□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.26□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 HERC1Q15751 4861 aa10.24□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.22□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 C1orf195Q5TG92 126 aa10.21□□□□□ -0.77
MFGE8-214ENST00000560937 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa10.2□□□□□ -0.78
MFGE8-214ENST00000560937 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa10.19□□□□□ -0.78
MFGE8-214ENST00000560937 ETDBQ3ZM63 59 aa10.17□□□□□ -0.78
MFGE8-214ENST00000560937 A0A1B0GW54 56 aa10.12□□□□□ -0.79
MFGE8-214ENST00000560937 Q96NJ1 140 aa10.11□□□□□ -0.79
MFGE8-214ENST00000560937 SIGMAR1Q99720 223 aa10.1□□□□□ -0.79
MFGE8-214ENST00000560937 TPRXLQ17RH7 258 aa10.09□□□□□ -0.79
MFGE8-214ENST00000560937 DEFB116Q30KQ4 102 aa10.08□□□□□ -0.8
MFGE8-214ENST00000560937 IGKV4-1P06312 121 aa10.07□□□□□ -0.8
MFGE8-214ENST00000560937 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.06□□□□□ -0.8
MFGE8-214ENST00000560937 NREPQ16612 68 aa10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-214ENST00000560937 CDIP1Q9H305 208 aa10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-214ENST00000560937 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.05□□□□□ -0.8
MFGE8-214ENST00000560937 C9orf92A6NGG3 77 aa10.04□□□□□ -0.8
MFGE8-214ENST00000560937 HMCN2Q8NDA2 5059 aa10.03□□□□□ -0.8
MFGE8-214ENST00000560937 J3KT08 172 aa10□□□□□ -0.81
MFGE8-214ENST00000560937 LPAP08519 4548 aa9.97□□□□□ -0.81
MFGE8-214ENST00000560937 Q6ZVQ6 151 aa9.97□□□□□ -0.81
MFGE8-214ENST00000560937 LINC00846Q9NV44 126 aa9.97□□□□□ -0.81
MFGE8-214ENST00000560937 UBL5Q9BZL1 73 aa9.96□□□□□ -0.82
MFGE8-214ENST00000560937 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-214ENST00000560937 XP32Q5T750 250 aa9.93□□□□□ -0.82
MFGE8-214ENST00000560937 BPY2O14599 106 aa9.92□□□□□ -0.82
MFGE8-214ENST00000560937 NDUFB1O75438 58 aa9.92□□□□□ -0.82
MFGE8-214ENST00000560937 DSCR10P59022 87 aa9.92□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms