RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560333.1

PDE8A-212, Transcript of phosphodiesterase 8A, humanhuman

TSL 3

Gene PDE8A, Length 543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE8A-212ENST00000560333 C6orf99Q4VX62 202 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 DPH3Q96FX2 82 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 A0A1B0GV90 55 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 TCL1BO95988 128 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 Q1RN00 199 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 REG3GQ6UW15 175 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.17□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 CLEC2BQ92478 149 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 DIRC1Q969H9 104 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 H0YGX0 51 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 LST1O00453 97 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 PSMB2P49721 201 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 UBE2BP63146 152 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 LINC00575Q6W349 94 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 Q9BRP9 147 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE8A-212ENST00000560333 COX7BP24311 80 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 H0Y9J4 135 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 K7EP34 96 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 BCE1O60756 84 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 FABP2P12104 132 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 Q6ZRX8 168 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 ERC2-IT1O76042 136 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 COX6CP09669 75 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 A0A1B0GX51 115 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 PRLHP81277 87 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 PRO0461Q9UI25 63 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 TRACP01848 142 aa6.1□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 VAMP3Q15836 100 aa6.1□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.1□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 H3BMG7 143 aa6.09□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 IGLV7-43P04211 117 aa6.09□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 ATXN8Q156A1 80 aa6.09□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 C1orf137Q5JT78 98 aa6.09□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 LINC01600Q96MT4 127 aa6.09□□□□□ -1.43
PDE8A-212ENST00000560333 hADV29S1A0JD25 119 aa6.08□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 ZNF861PO60384 105 aa6.08□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 UBE2V1Q13404 147 aa6.08□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.08□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 UBE2AP49459 152 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 Q6ZQY7 126 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.05□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 Q8N377 158 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 MTURNQ8N3F0 131 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 C9JAW5 83 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 SLC25A20O43772 301 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 SPRR1BP22528 89 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 SMIM29Q86T20 159 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE8A-212ENST00000560333 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 H3BT86 120 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 SPRR4Q96PI1 79 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 F8W1H4 67 aa6□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 LINC00483Q53H64 154 aa6□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 OCIAD2Q56VL3 154 aa6□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 DNAL4O96015 105 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 SNCGO76070 127 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE8A-212ENST00000560333 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 H3BQ85 93 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 ETDBQ3ZM63 59 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 A0A087X002 238 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 TEN1Q86WV5 123 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.91□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 A0A0G2JQZ4 141 aa5.9□□□□□ -1.46
PDE8A-212ENST00000560333 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE8A-212ENST00000560333 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.89□□□□□ -1.47
PDE8A-212ENST00000560333 KRTAP10-8P60410 259 aa5.88□□□□□ -1.47
PDE8A-212ENST00000560333 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47 ms