RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560253.1

MEIS3-208, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,060 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-208ENST00000560253 HIGD1BQ9P298 99 aa8.38□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.38□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 SMIM29Q86T20 159 aa8.37□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 C12orf57Q99622 126 aa8.37□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.35□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 A6NJY4 79 aa8.35□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 Q6ZQY7 126 aa8.35□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
MEIS3-208ENST00000560253 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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MEIS3-208ENST00000560253 H0YGX0 51 aa8.32□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 TCL1BO95988 128 aa8.32□□□□□ -1.08
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MEIS3-208ENST00000560253 CFC1P0CG37 223 aa8.32□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 Q6JHZ5 121 aa8.32□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.32□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 A0A0B4J2C4 111 aa8.31□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 GHRHP01286 108 aa8.31□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 Q5XG85 94 aa8.31□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.3□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.29□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 CEND1Q8N111 149 aa8.29□□□□□ -1.08
MEIS3-208ENST00000560253 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.27□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.27□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.26□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 XP32Q5T750 250 aa8.25□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 CLEC2BQ92478 149 aa8.25□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.24□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 A0A0G2JQZ4 141 aa8.24□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 A0A1B0GX51 115 aa8.24□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 PYY3Q5JQD4 70 aa8.24□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 C1orf195Q5TG92 126 aa8.23□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 C9orf92A6NGG3 77 aa8.22□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 HSD52Q0P140 79 aa8.22□□□□□ -1.09
MEIS3-208ENST00000560253 IGFL1Q6UW32 110 aa8.21□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 COX6CP09669 75 aa8.2□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 FXYD2P54710 66 aa8.2□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.19□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 UQCR10Q9UDW1 63 aa8.19□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 H3BQ85 93 aa8.18□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 PSMB2P49721 201 aa8.18□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 DNAL4O96015 105 aa8.17□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 FABP2P12104 132 aa8.17□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.16□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 H3BUT2 72 aa8.15□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.15□□□□□ -1.1
MEIS3-208ENST00000560253 LST1O00453 97 aa8.14□□□□□ -1.11
MEIS3-208ENST00000560253 TRIAP1O43715 76 aa8.14□□□□□ -1.11
MEIS3-208ENST00000560253 TEN1Q86WV5 123 aa8.14□□□□□ -1.11
MEIS3-208ENST00000560253 H3BMG7 143 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS3-208ENST00000560253 SMIM6P0DI80 62 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS3-208ENST00000560253 MUC17Q685J3 4493 aa8.13□□□□□ -1.11
MEIS3-208ENST00000560253 PCOTHQ58A44 107 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS3-208ENST00000560253 Q6Q795 121 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS3-208ENST00000560253 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.11□□□□□ -1.11
MEIS3-208ENST00000560253 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.09□□□□□ -1.11
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MEIS3-208ENST00000560253 K7ERJ3 54 aa8.07□□□□□ -1.12
MEIS3-208ENST00000560253 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
MEIS3-208ENST00000560253 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.06□□□□□ -1.12
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.05□□□□□ -1.12
MEIS3-208ENST00000560253 A0A087WSZ3 146 aa8.04□□□□□ -1.12
MEIS3-208ENST00000560253 M0R143 59 aa8.02□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 TRACP01848 142 aa8.02□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.01□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 UBE2V1Q13404 147 aa8.01□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.01□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.99□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 Q96NJ1 140 aa7.98□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 A0A1B0GV72 72 aa7.97□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 A0A1W2PNM2 257 aa7.97□□□□□ -1.13
MEIS3-208ENST00000560253 CCKP06307 115 aa7.96□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 Q75L30 129 aa7.96□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 TSTD3H0UI37 97 aa7.95□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 DSCR8Q96T75 97 aa7.95□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 SIGMAR1Q99720 223 aa7.95□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.94□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.93□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 VPS25Q9BRG1 176 aa7.93□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 IGKV4-1P06312 121 aa7.92□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 ATXN8Q156A1 80 aa7.92□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.92□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.91□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 C9JAW5 83 aa7.9□□□□□ -1.14
MEIS3-208ENST00000560253 LINC00313P59037 77 aa7.89□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.87□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.87□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 DSCR10P59022 87 aa7.86□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 A8MUU9 505 aa7.85□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.84□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 PDE6GP18545 87 aa7.84□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 LCE2CQ5TA81 110 aa7.84□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.84□□□□□ -1.15
MEIS3-208ENST00000560253 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.83□□□□□ -1.16
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