RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556077.5

TTC8-211, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 8, humanhuman

TSL 5

Gene TTC8, Length 1,020 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC8-211ENST00000556077 VAMP8Q9BV40 100 aa7.11□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 DLEU1O43261 78 aa7.1□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 COX8AP10176 69 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 Q6ZVH6 145 aa7.09□□□□□ -1.27
TTC8-211ENST00000556077 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 C6orf99Q4VX62 202 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 SPATA45Q537H7 98 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.08□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.07□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 A0A1B0GWB2 263 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 A4D1N5 150 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 SMIM6P0DI80 62 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 IFITM1P13164 125 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 COPS9Q8WXC6 57 aa7.05□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 Q75L30 129 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 C14orf144Q96I85 54 aa7.04□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 HIGD1BQ9P298 99 aa7.03□□□□□ -1.28
TTC8-211ENST00000556077 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC8-211ENST00000556077 F8WEM9 126 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.01□□□□□ -1.29
TTC8-211ENST00000556077 C2orf91Q6ZV80 131 aa7□□□□□ -1.29
TTC8-211ENST00000556077 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.99□□□□□ -1.29
TTC8-211ENST00000556077 Q6JHZ5 121 aa6.98□□□□□ -1.29
TTC8-211ENST00000556077 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.98□□□□□ -1.29
TTC8-211ENST00000556077 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.98□□□□□ -1.29
TTC8-211ENST00000556077 A0A0G2JQZ4 141 aa6.97□□□□□ -1.29
TTC8-211ENST00000556077 HIST1H4GQ99525 98 aa6.96□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 A6NDN8 102 aa6.95□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 LINC00846Q9NV44 126 aa6.95□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 C12orf57Q99622 126 aa6.94□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 SSPOA2VEC9 5147 aa6.94□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 USH2AO75445 5202 aa6.94□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.93□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 VAMP3Q15836 100 aa6.93□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.92□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 HSD52Q0P140 79 aa6.92□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 CEND1Q8N111 149 aa6.92□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 CLEC2BQ92478 149 aa6.92□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 Q96NJ1 140 aa6.92□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 LST1O00453 97 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC8-211ENST00000556077 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 A6NJY4 79 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 A0A0B4J2C4 111 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 TSTD3H0UI37 97 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 FXYD2P54710 66 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 IGFL1Q6UW32 110 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.86□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 hADV29S1A0JD25 119 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 A8MUU9 505 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 MT2AP02795 61 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 FAM236CP0DP71 79 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 LINC00575Q6W349 94 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.84□□□□□ -1.31
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP10-10P60014 251 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 RAB37Q96AX2 223 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.83□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 LCE2BO14633 110 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 Q6ZQY7 126 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.82□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 M0R143 59 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.81□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
TTC8-211ENST00000556077 MT1FP04733 61 aa6.77□□□□□ -1.33
TTC8-211ENST00000556077 H0YGX0 51 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC8-211ENST00000556077 K7ERJ3 54 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC8-211ENST00000556077 SNCGO76070 127 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC8-211ENST00000556077 TEN1Q86WV5 123 aa6.76□□□□□ -1.33
TTC8-211ENST00000556077 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
TTC8-211ENST00000556077 MTURNQ8N3F0 131 aa6.75□□□□□ -1.33
TTC8-211ENST00000556077 TRIAP1O43715 76 aa6.72□□□□□ -1.33
TTC8-211ENST00000556077 A0A1B0GX51 115 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 LINC00313P59037 77 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.71□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 H3BUT2 72 aa6.7□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 COX6CP09669 75 aa6.7□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.7□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 GHRHP01286 108 aa6.69□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 PSMB2P49721 201 aa6.69□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 DSCR10P59022 87 aa6.68□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.68□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 A0A087WSZ3 146 aa6.67□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 BATFQ16520 125 aa6.67□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 HRES1P13985 223 aa6.66□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.66□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.65□□□□□ -1.34
TTC8-211ENST00000556077 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 192.8 ms