RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550700.1

CS-220, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 559 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-220ENST00000550700 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 SPRR1BP22528 89 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 Q6ZQY7 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 FAM218AQ96MZ4 157 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-220ENST00000550700 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 SPRR4Q96PI1 79 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 K7EP34 96 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 ERC2-IT1O76042 136 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 LINC00483Q53H64 154 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.63□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 F8WEM9 126 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 H3BT86 120 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 CRYGAP11844 174 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 UBE2V1Q13404 147 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 H3BMG7 143 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 C9JAW5 83 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 F8W1H4 67 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 Q8N377 158 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 RYR1P21817 5038 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-220ENST00000550700 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP5.58□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 LINC01600Q96MT4 127 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 OXTP01178 125 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 Q6JHZ5 121 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.57□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 PDE6GP18545 87 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 Q8NBF4 154 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 HSPG2P98160 4391 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GV90 55 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 SMIM29Q86T20 159 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 DSCR8Q96T75 97 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-220ENST00000550700 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 PRO0461Q9UI25 63 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GW54 56 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 H3BS24 57 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 CD164Q04900 197 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 MOBPQ13875 183 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 FAT1Q14517 4588 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 A0A087X002 238 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 TEN1Q86WV5 123 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.5□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 KRTAP10-8P60410 259 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 Q6Q795 121 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 MTURNQ8N3F0 131 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 SPINK1P00995 79 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 IGFL1Q6UW32 110 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CS-220ENST00000550700 CCKP06307 115 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 ETDBQ3ZM63 59 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 LIMD2Q9BT23 127 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 HERC2O95714 4834 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 Q6ZQT0 140 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 J3QR89 54 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 LCE4AQ5TA78 99 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 Q5XG85 94 aa5.43□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa5.42□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 A0A1B0GV72 72 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 A0A1W2PNM2 257 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 ACYP1P07311 99 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 VPS25Q9BRG1 176 aa5.41□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 MT1HL1P0DM35 61 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.4□□□□□ -1.54
CS-220ENST00000550700 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 A0A087WSZ3 146 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
CS-220ENST00000550700 A0A0G2JQZ4 141 aa5.36□□□□□ -1.55
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