RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542555.1

CLPB-211, Transcript of ClpB homolog, mitochondrial AAA ATPase chaperonin, humanhuman

TSL 2

Gene CLPB, Length 421 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPB-211ENST00000542555 NPC2P61916 151 aa4.06□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 F8WEM9 126 aa4.05□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 C18orf32Q8TCD1 76 aa4.05□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.05□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.05□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 USH2AO75445 5202 aa4.05□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 H0Y8G0 127 aa4.04□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 J3QQQ9 107 aa4.04□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 MT2AP02795 61 aa4.04□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.04□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 Q96NJ1 140 aa4.03□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 SPANXDQ9BXN6 97 aa4.03□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.03□□□□□ -1.76
CLPB-211ENST00000542555 PLNP26678 52 aa4.02□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.02□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.02□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 SPANXCQ9NY87 97 aa4.02□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.01□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 A0A0G2JQZ4 141 aa4□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 HSBP1O75506 76 aa4□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 TSPEAR-AS2P59090 65 aa4□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.99□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 A0A1B0GWB2 263 aa3.99□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 ZNF815PA8K554 130 aa3.99□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 DPM2O94777 84 aa3.99□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 MT1FP04733 61 aa3.99□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.99□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.99□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.98□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 A0A0J9YXY3 114 aa3.98□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 A4D1N5 150 aa3.98□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 LST1O00453 97 aa3.98□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 Q6JHZ5 121 aa3.98□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 IGFL1Q6UW32 110 aa3.98□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 UQCC3Q6UW78 93 aa3.98□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 MTURNQ8N3F0 131 aa3.98□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.98□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 TMEM218A2RU14 115 aa3.97□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.97□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.97□□□□□ -1.77
CLPB-211ENST00000542555 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.96□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.96□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 LEPROTL1O95214 131 aa3.96□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 IGKCP01834 107 aa3.96□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 COPS9Q8WXC6 57 aa3.96□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 A6NDN8 102 aa3.95□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 CLEC2BQ92478 149 aa3.95□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.95□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 TIMM17BO60830 172 aa3.94□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 VAMP3Q15836 100 aa3.94□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 Q6ZVH6 145 aa3.94□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.94□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 A8MUU9 505 aa3.93□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 E9PLD3 99 aa3.92□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 SERF1AO75920 110 aa3.92□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.92□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 CLLU1Q5K131 121 aa3.92□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.92□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 SCGB1D1O95968 90 aa3.91□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.91□□□□□ -1.78
CLPB-211ENST00000542555 FABP4P15090 132 aa3.9□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 A8MWP4 228 aa3.89□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.89□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.88□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 LITAFQ99732 161 aa3.88□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 hADV29S1A0JD25 119 aa3.87□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 IFITM1P13164 125 aa3.87□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 DSCR10P59022 87 aa3.87□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 NDUFA5Q16718 116 aa3.87□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.87□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 SNAPINO95295 136 aa3.86□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 LINC00313P59037 77 aa3.86□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 Q6ZQY7 126 aa3.86□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 HRES1P13985 223 aa3.85□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.85□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.85□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 SIGMAR1Q99720 223 aa3.85□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 NEBP20929 6669 aa3.85□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 SNCGO76070 127 aa3.84□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 APOC3P02656 99 aa3.84□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 KRTAP12-2P59991 146 aa3.84□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 LINC00575Q6W349 94 aa3.84□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.84□□□□□ -1.79
CLPB-211ENST00000542555 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 TEN1Q86WV5 123 aa3.83□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 SVBPQ8N300 66 aa3.83□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 C12orf57Q99622 126 aa3.83□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 A0A087WSZ3 146 aa3.81□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 COLCA2A8K830 154 aa3.81□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 H3BUT2 72 aa3.81□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.81□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.81□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.8□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.79□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 TRGC2P03986 189 aa3.79□□□□□ -1.8
CLPB-211ENST00000542555 IGKV4-1P06312 121 aa3.79□□□□□ -1.8
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