RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538708.5

PTPRB-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-204ENST00000538708 Q5W150 140 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 H7BZZ5 65 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 PANO1I0J062 215 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 CDH23Q9H251 3354 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 OCR1Q9BZK8 76 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 PLAC4Q8WY50 150 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 LCA10Q71F78 164 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 ITPR3Q14573 2671 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 DMAC1Q96GE9 116 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRB-204ENST00000538708 A0A087X002 238 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRB-204ENST00000538708 M0QZ58 72 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-204ENST00000538708 Q1T7F1 81 aa5.56□□□□□ -1.52
PTPRB-204ENST00000538708 UNC80Q8N2C7 3258 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-204ENST00000538708 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRB-204ENST00000538708 LUZP6Q538Z0 58 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-204ENST00000538708 SZT2Q5T011 3432 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-204ENST00000538708 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-204ENST00000538708 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-204ENST00000538708 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-204ENST00000538708 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-204ENST00000538708 ZNF292O60281 2723 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRB-204ENST00000538708 TRIOO75962 3097 aa5.48□□□□□ -1.53
PTPRB-204ENST00000538708 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
PTPRB-204ENST00000538708 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 CFAP46Q8IYW2 2715 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 Q75L30 129 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 USP24Q9UPU5 2620 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 ATRQ13535 2644 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 MAST4O15021 2626 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.54
PTPRB-204ENST00000538708 REV3LO60673 3130 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-204ENST00000538708 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-204ENST00000538708 BAHCC1Q9P281 2608 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-204ENST00000538708 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.39□□□□□ -1.55
PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRB-204ENST00000538708 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRB-204ENST00000538708 AKAP13Q12802 2813 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-204ENST00000538708 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRB-204ENST00000538708 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRB-204ENST00000538708 A8MUU9 505 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-204ENST00000538708 ROMO1P60602 79 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-204ENST00000538708 LAMA1P25391 3075 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-204ENST00000538708 COL6A3P12111 3177 aa5.33□□□□□ -1.56
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0C4DFX4 3053 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.32□□□□□ -1.56
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PTPRB-204ENST00000538708 EYSQ5T1H1 3165 aa5.3□□□□□ -1.56
PTPRB-204ENST00000538708 WDFY4Q6ZS81 3184 aa5.29□□□□□ -1.56
PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.28□□□□□ -1.56
PTPRB-204ENST00000538708 VCANP13611 3396 aa5.28□□□□□ -1.56
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PTPRB-204ENST00000538708 Q5XG85 94 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRB-204ENST00000538708 Q5VV11 94 aa5.26□□□□□ -1.57
PTPRB-204ENST00000538708 VPS13AQ96RL7 3174 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRB-204ENST00000538708 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-204ENST00000538708 PRAC1Q96KF2 57 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-204ENST00000538708 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.23□□□□□ -1.57
PTPRB-204ENST00000538708 STAB1Q9NY15 2570 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-204ENST00000538708 TEX15Q9BXT5 2789 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRB-204ENST00000538708 A0A1B0GVY2 172 aa5.22□□□□□ -1.57
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PTPRB-204ENST00000538708 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-204ENST00000538708 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.2□□□□□ -1.58
PTPRB-204ENST00000538708 XP32Q5T750 250 aa5.17□□□□□ -1.58
PTPRB-204ENST00000538708 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-204ENST00000538708 CFAP54Q96N23 3096 aa5.16□□□□□ -1.58
PTPRB-204ENST00000538708 FRYLO94915 3013 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 A0A0A0MQY5 61 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 A8MU10 97 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 COL6A5A8TX70 2615 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 ITPR2Q14571 2701 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 TNP1P09430 55 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 CENPEQ02224 2701 aa5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 SPEGQ15772 3267 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP10-10P60014 251 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 USP34Q70CQ2 3546 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 FRYQ5TBA9 3013 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-204ENST00000538708 KRTAP10-8P60410 259 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-204ENST00000538708 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-204ENST00000538708 CHD6Q8TD26 2715 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-204ENST00000538708 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRB-204ENST00000538708 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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