RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529919.5

CTNND1-222, Transcript of catenin delta 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CTNND1, Length 4,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNND1-222	ENST00000529919	COL12A1	Q99715	3063 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	5.18	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	ITPR1	Q14643	2758 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	TENM4	Q6N022	2769 aa		5.18	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919		A0A087WTM6	91 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	ATM	Q13315	3056 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	ZNF861P	O60384	105 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	CASC10	Q5T4H9	136 aa		5.15	□□□□□ -1.58
CTNND1-222	ENST00000529919	HIVEP1	P15822	2718 aa		5.15	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	LAMA1	P25391	3075 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	OCR1	Q9BZK8	76 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	FAM104A	Q969W3	186 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		5.13	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	WIPF1	O43516	503 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	SPEG	Q15772	3267 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919		A0A0D9SG42	100 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	C9orf92	A6NGG3	77 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919		Q8N1X5	172 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919		Q1T7F1	81 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		5.11	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	DMD	P11532	3685 aa		5.1	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	LINC01554	Q52M75	96 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CTNND1-222	ENST00000529919	TNP2	Q05952	138 aa		5.09	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	ZNF575	Q86XF7	245 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		5.06	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	ZZEF1	O43149	2961 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.05	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919		Q5XG85	94 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	KALRN	O60229	2985 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		5.03	□□□□□ -1.6
CTNND1-222	ENST00000529919	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919		Q75L30	129 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.02	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919		A0A1B0GU33	70 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919	HRES1	P13985	223 aa		5	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919	LCE6A	A0A183	80 aa		5	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919		H3BS24	57 aa		5	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919	APC	P25054	2843 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CTNND1-222	ENST00000529919	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919		Q5VV11	94 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.95	□□□□□ -1.62	1e-6	■□□□□ 9
CTNND1-222	ENST00000529919	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919		Q8NDZ9	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	SPINK7	P58062	85 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	OXT	P01178	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	LRBA	P50851	2863 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CTNND1-222	ENST00000529919	SPRR1A	P35321	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919	ZAN	Q9Y493	2812 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919		Q6ZSA8	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919	DMAC1	Q96GE9	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919		Q5W150	140 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919		Q5VSD8	79 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919		A0A0A0MQY5	61 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNND1-222	ENST00000529919	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNND1-222	ENST00000529919	SPRR1B	P22528	89 aa		4.83	□□□□□ -1.64

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