RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529795.1

PACS1-210, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene PACS1, Length 448 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-210ENST00000529795 H0YGX0 51 aa7.1□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 TCL1BO95988 128 aa7.1□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.1□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 Q6JHZ5 121 aa7.1□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 Q6ZQY7 126 aa7.1□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.09□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 C12orf57Q99622 126 aa7.09□□□□□ -1.27
PACS1-210ENST00000529795 A0A0B4J2C4 111 aa7.08□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 CFC1BP0CG36 223 aa7.07□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 CFC1P0CG37 223 aa7.07□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.07□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 MUC2Q02817 5179 aa7.07□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 XP32Q5T750 250 aa7.05□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 CEND1Q8N111 149 aa7.05□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.04□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 A0A1B0GX51 115 aa7.04□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.04□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.03□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 CLEC2BQ92478 149 aa7.03□□□□□ -1.28
PACS1-210ENST00000529795 C1orf195Q5TG92 126 aa7.01□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 H3BQ85 93 aa7□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 HSD52Q0P140 79 aa6.99□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 PYY3Q5JQD4 70 aa6.99□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 MUC17Q685J3 4493 aa6.98□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.98□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 COX6CP09669 75 aa6.98□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 IGFL1Q6UW32 110 aa6.98□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 A0A0G2JQZ4 141 aa6.97□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 C9orf92A6NGG3 77 aa6.97□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.97□□□□□ -1.29
PACS1-210ENST00000529795 DNAL4O96015 105 aa6.96□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.96□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 FXYD2P54710 66 aa6.95□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 LST1O00453 97 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 PSMB2P49721 201 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 Q6Q795 121 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 TEN1Q86WV5 123 aa6.94□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 FABP2P12104 132 aa6.93□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 H3BMG7 143 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 TRIAP1O43715 76 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.92□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 H3BUT2 72 aa6.91□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.91□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.9□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 PCOTHQ58A44 107 aa6.9□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
PACS1-210ENST00000529795 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.88□□□□□ -1.31
PACS1-210ENST00000529795 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PACS1-210ENST00000529795 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.86□□□□□ -1.31
PACS1-210ENST00000529795 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.85□□□□□ -1.31
PACS1-210ENST00000529795 A0A087WSZ3 146 aa6.84□□□□□ -1.31
PACS1-210ENST00000529795 K7ERJ3 54 aa6.84□□□□□ -1.31
PACS1-210ENST00000529795 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.83□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 TRACP01848 142 aa6.83□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 UBE2V1Q13404 147 aa6.83□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 M0R143 59 aa6.82□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.82□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.81□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.8□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 Q75L30 129 aa6.8□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 A0A1W2PNM2 257 aa6.78□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 Q96NJ1 140 aa6.78□□□□□ -1.32
PACS1-210ENST00000529795 CCKP06307 115 aa6.77□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 SMIM6P0DI80 62 aa6.77□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 DSCR8Q96T75 97 aa6.77□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 SIGMAR1Q99720 223 aa6.75□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.74□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.74□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 A0A1B0GV72 72 aa6.73□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 TSTD3H0UI37 97 aa6.73□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 IGKV4-1P06312 121 aa6.73□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 LINC00313P59037 77 aa6.73□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 ATXN8Q156A1 80 aa6.73□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.73□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 C9JAW5 83 aa6.72□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.72□□□□□ -1.33
PACS1-210ENST00000529795 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.71□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 VPS25Q9BRG1 176 aa6.71□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 A8MUU9 505 aa6.7□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.7□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 A0A1B0GW54 56 aa6.69□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 PDE6GP18545 87 aa6.69□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 LCE2CQ5TA81 110 aa6.69□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.68□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.68□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 J3KT08 172 aa6.67□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 DSCR10P59022 87 aa6.67□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.67□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 C8orf87E5RJ46 101 aa6.65□□□□□ -1.34
PACS1-210ENST00000529795 M0R2T5 61 aa6.64□□□□□ -1.35
PACS1-210ENST00000529795 NDUFB1O75438 58 aa6.64□□□□□ -1.35
PACS1-210ENST00000529795 MT1HP80294 61 aa6.64□□□□□ -1.35
PACS1-210ENST00000529795 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.63□□□□□ -1.35
PACS1-210ENST00000529795 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.63□□□□□ -1.35
PACS1-210ENST00000529795 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.62□□□□□ -1.35
PACS1-210ENST00000529795 Q6ZQT0 140 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.2 ms