RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000528149.5

CCDC90B-210, Transcript of coiled-coil domain containing 90B, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC90B, Length 987 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90B-210ENST00000528149 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.81□□□□□ -1.32
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CCDC90B-210ENST00000528149 PRO0461Q9UI25 63 aa6.51□□□□□ -1.37
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CCDC90B-210ENST00000528149 DSCR8Q96T75 97 aa6.5□□□□□ -1.37
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CCDC90B-210ENST00000528149 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.5□□□□□ -1.37
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CCDC90B-210ENST00000528149 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.49□□□□□ -1.37
CCDC90B-210ENST00000528149 CCKP06307 115 aa6.49□□□□□ -1.37
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CCDC90B-210ENST00000528149 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC90B-210ENST00000528149 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC90B-210ENST00000528149 C1orf195Q5TG92 126 aa6.46□□□□□ -1.38
CCDC90B-210ENST00000528149 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CCDC90B-210ENST00000528149 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC90B-210ENST00000528149 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.45□□□□□ -1.38
CCDC90B-210ENST00000528149 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.43□□□□□ -1.38
CCDC90B-210ENST00000528149 PDE6GP18545 87 aa6.42□□□□□ -1.38
CCDC90B-210ENST00000528149 F8W1H4 67 aa6.41□□□□□ -1.38
CCDC90B-210ENST00000528149 Q96NJ1 140 aa6.41□□□□□ -1.38
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