RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527026.1

PTPRJ-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRJ, Length 555 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-204ENST00000527026 CTAG1AP78358 180 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 MOBPQ13875 183 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 TAL2Q16559 108 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.06□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 SPINK1P00995 79 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.04□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRJ-204ENST00000527026 A4D1N5 150 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 SPRR1BP22528 89 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 C14orf144Q96I85 54 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 A0A1B0GWB2 263 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 COX8AP10176 69 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 HIST1H4GQ99525 98 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 VAMP3Q15836 100 aa5□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 Q1RN00 199 aa5□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 MUC2Q02817 5179 aa5□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 SLC25A20O43772 301 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 SMIM29Q86T20 159 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 Q8N377 158 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 MUC17Q685J3 4493 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 DLEU1O43261 78 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 TPRXLQ17RH7 258 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 SPATA45Q537H7 98 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 C12orf57Q99622 126 aa4.98□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 A0A0G2JQZ4 141 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 LINC00575Q6W349 94 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRJ-204ENST00000527026 CFC1BP0CG36 223 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 CFC1P0CG37 223 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 VAMP8Q9BV40 100 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 PRO1933Q9H354 126 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 hADV29S1A0JD25 119 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 H7C2G1 150 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 UBE2V1Q13404 147 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 HIGD1BQ9P298 99 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 Q6ZQY7 126 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 RAB37Q96AX2 223 aa4.93□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 CD164Q04900 197 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 PYY3Q5JQD4 70 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 CEND1Q8N111 149 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 LIMD2Q9BT23 127 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRJ-204ENST00000527026 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 Q75L30 129 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 SNHG12Q9BXW3 62 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 F8WEM9 126 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 H0YGX0 51 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 A0A0B4J2C4 111 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 C9orf92A6NGG3 77 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 FXYD2P54710 66 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 C1orf195Q5TG92 126 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 SNCGO76070 127 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 Q5XG85 94 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 A0A0U1RQV1 116 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 TCL1BO95988 128 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 Q6JHZ5 121 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 IGFL1Q6UW32 110 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRJ-204ENST00000527026 H3BUT2 72 aa4.84□□□□□ -1.63
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PTPRJ-204ENST00000527026 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 HSD52Q0P140 79 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.83□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 FABP2P12104 132 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 PSMB2P49721 201 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 LCE1EQ5T753 118 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 CLEC2BQ92478 149 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 A0A1B0GX51 115 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 K7ERJ3 54 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 PCOTHQ58A44 107 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 H3BMG7 143 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 COX6CP09669 75 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 LST1O00453 97 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.78□□□□□ -1.64
PTPRJ-204ENST00000527026 TEN1Q86WV5 123 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRJ-204ENST00000527026 DNAL4O96015 105 aa4.76□□□□□ -1.65
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