RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526481.6

CTSB-211, Transcript of cathepsin B, humanhuman

TSL 5

Gene CTSB, Length 660 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSB-211ENST00000526481 Q6ZQY7 126 aa8.68□□□□□ -1.02
CTSB-211ENST00000526481 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CTSB-211ENST00000526481 LST1O00453 97 aa8.67□□□□□ -1.02
CTSB-211ENST00000526481 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
CTSB-211ENST00000526481 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.66□□□□□ -1.02
CTSB-211ENST00000526481 MYCBP2O75592 4640 aa8.66□□□□□ -1.02
CTSB-211ENST00000526481 CDIP1Q9H305 208 aa8.65□□□□□ -1.02
CTSB-211ENST00000526481 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTSB-211ENST00000526481 A0A1B0GX51 115 aa8.64□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.64□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.64□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 FABP2P12104 132 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 LINC00483Q53H64 154 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa8.63□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 A0A087X002 238 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 TRACP01848 142 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 ATXN8Q156A1 80 aa8.62□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 SPRR1BP22528 89 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 Q8N377 158 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.61□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 DNAL4O96015 105 aa8.6□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 SMIM29Q86T20 159 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.59□□□□□ -1.03
CTSB-211ENST00000526481 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.58□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa8.58□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 SNCGO76070 127 aa8.58□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.58□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.57□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 TNXBP22105 4242 aa8.57□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 K7EP34 96 aa8.57□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 MTURNQ8N3F0 131 aa8.57□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.57□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 H3BMG7 143 aa8.56□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.55□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 C9JAW5 83 aa8.55□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 CRYGAP11844 174 aa8.55□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 LINC01600Q96MT4 127 aa8.55□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.54□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 MOBPQ13875 183 aa8.53□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.53□□□□□ -1.04
CTSB-211ENST00000526481 A0A1B0GV90 55 aa8.52□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 MT1HL1P0DM35 61 aa8.52□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.52□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.52□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 A0A1B0GV72 72 aa8.51□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.51□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 OXTP01178 125 aa8.5□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa8.5□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 A0A0G2JQZ4 141 aa8.49□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 KRTAP10-8P60410 259 aa8.49□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 Q8NBF4 154 aa8.49□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.49□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 PRO0461Q9UI25 63 aa8.49□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 F8WEM9 126 aa8.48□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.48□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.47□□□□□ -1.05
CTSB-211ENST00000526481 H3BQ85 93 aa8.46□□□□□ -1.06
CTSB-211ENST00000526481 H3BT86 120 aa8.46□□□□□ -1.06
CTSB-211ENST00000526481 UBE2V1Q13404 147 aa8.46□□□□□ -1.06
CTSB-211ENST00000526481 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
CTSB-211ENST00000526481 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.45□□□□□ -1.06
CTSB-211ENST00000526481 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.45□□□□□ -1.06
CTSB-211ENST00000526481 IGFL1Q6UW32 110 aa8.43□□□□□ -1.06
CTSB-211ENST00000526481 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.42□□□□□ -1.06
CTSB-211ENST00000526481 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.41□□□□□ -1.06
CTSB-211ENST00000526481 Q6JHZ5 121 aa8.39□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.39□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.37□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.37□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.37□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.36□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 A0A1W2PNM2 257 aa8.35□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 F8W1H4 67 aa8.34□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.34□□□□□ -1.07
CTSB-211ENST00000526481 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.32□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 Q6ZQT0 140 aa8.32□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 DSCR8Q96T75 97 aa8.32□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.31□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 CD164Q04900 197 aa8.31□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 ETDBQ3ZM63 59 aa8.31□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 TEN1Q86WV5 123 aa8.31□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 CCKP06307 115 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 VPS25Q9BRG1 176 aa8.3□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 SPINK1P00995 79 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 Q6Q795 121 aa8.29□□□□□ -1.08
CTSB-211ENST00000526481 A0A087WSZ3 146 aa8.26□□□□□ -1.09
CTSB-211ENST00000526481 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.26□□□□□ -1.09
CTSB-211ENST00000526481 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
CTSB-211ENST00000526481 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa8.25□□□□□ -1.09
CTSB-211ENST00000526481 HERC1Q15751 4861 aa8.25□□□□□ -1.09
CTSB-211ENST00000526481 LIMD2Q9BT23 127 aa8.24□□□□□ -1.09
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