RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 GAGE2AQ6NT46 116 aa9.38□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9.38□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 Q8N377 158 aa9.37□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 INAFM2P0DMQ5 153 aa9.37□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 CDK2AP2O75956 126 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 A0A1B0GX51 115 aa9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.35□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 H3BT86 120 aa9.34□□□□□ -0.91
TRPS1-206ENST00000517323 A0A0G2JQZ4 141 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 CCDC179H3BU77 68 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 Q5VSD8 79 aa9.33□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 SPRR4Q96PI1 79 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 MYCBP2O75592 4640 aa9.31□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 SMIM29Q86T20 159 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa9.29□□□□□ -0.92
TRPS1-206ENST00000517323 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 FAM229AH3BQW9 127 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.27□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 C14orf132Q9NPU4 83 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 A0A087X002 238 aa9.26□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 ACYP1P07311 99 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 IMUPQ9GZP8 106 aa9.24□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.23□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00483Q53H64 154 aa9.22□□□□□ -0.93
TRPS1-206ENST00000517323 Q8N1X5 172 aa9.22□□□□□ -0.93
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TRPS1-206ENST00000517323 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.21□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 C9orf153Q5TBE3 101 aa9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 MOBPQ13875 183 aa9.19□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa9.19□□□□□ -0.94
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TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.19□□□□□ -0.94
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TRPS1-206ENST00000517323 LINC00643Q86TS7 51 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 F8WEM9 126 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 IGFL1Q6UW32 110 aa9.16□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 FAT3Q8TDW7 4589 aa9.15□□□□□ -0.94
TRPS1-206ENST00000517323 GHRHP01286 108 aa9.14□□□□□ -0.95
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TRPS1-206ENST00000517323 A0A1W2PNM2 257 aa9.11□□□□□ -0.95
TRPS1-206ENST00000517323 CCKP06307 115 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-206ENST00000517323 CRYGAP11844 174 aa9.1□□□□□ -0.95
TRPS1-206ENST00000517323 Q8NBF4 154 aa9.09□□□□□ -0.95
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TRPS1-206ENST00000517323 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.08□□□□□ -0.96
TRPS1-206ENST00000517323 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa9.07□□□□□ -0.96
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TRPS1-206ENST00000517323 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.06□□□□□ -0.96
TRPS1-206ENST00000517323 COX7CP15954 63 aa9.05□□□□□ -0.96
TRPS1-206ENST00000517323 ATOX1O00244 68 aa9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-206ENST00000517323 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00846Q9NV44 126 aa9.02□□□□□ -0.97
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TRPS1-206ENST00000517323 Q6JHZ5 121 aa9□□□□□ -0.97
TRPS1-206ENST00000517323 J3KT08 172 aa9□□□□□ -0.97
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TRPS1-206ENST00000517323 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.97□□□□□ -0.97
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TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP10-8P60410 259 aa8.93□□□□□ -0.98
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TRPS1-206ENST00000517323 TMEM258P61165 79 aa8.92□□□□□ -0.98
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TRPS1-206ENST00000517323 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.89□□□□□ -0.99
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TRPS1-206ENST00000517323 NREPQ16612 68 aa8.86□□□□□ -0.99
TRPS1-206ENST00000517323 Q96NJ1 140 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-206ENST00000517323 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-206ENST00000517323 Q8N9L7 120 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-206ENST00000517323 UBL5Q9BZL1 73 aa8.85□□□□□ -0.99
TRPS1-206ENST00000517323 CD164Q04900 197 aa8.84□□□□□ -0.99
TRPS1-206ENST00000517323 A0A087WVE0 104 aa8.83□□□□□ -1
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