RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6ZQY7	126 aa		6.4	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		6.4	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		6.4	□□□□□ -1.38
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0B4J2C4	111 aa		6.39	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		6.39	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6JHZ5	121 aa		6.39	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	CEND1	Q8N111	149 aa		6.38	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		6.37	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	CFC1B	P0CG36	223 aa		6.36	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	CFC1	P0CG37	223 aa		6.36	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM29	Q86T20	159 aa		6.36	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		6.36	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	6.35	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	6.35	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	COX6C	P09669	75 aa		6.34	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246		Q5XG85	94 aa		6.34	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	CLEC2B	Q92478	149 aa		6.34	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF213	Q63HN8	5207 aa		6.34	□□□□□ -1.39
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GX51	115 aa		6.33	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAL4	O96015	105 aa		6.33	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMB2	P49721	201 aa		6.33	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BQ85	93 aa		6.32	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	HSD52	Q0P140	79 aa		6.32	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		6.31	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		6.31	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		6.31	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	PYY3	Q5JQD4	70 aa		6.3	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		6.3	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	FABP2	P12104	132 aa		6.29	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	C9orf92	A6NGG3	77 aa		6.28	□□□□□ -1.4
TTLL3-231	ENST00000496246	FXYD2	P54710	66 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	XP32	Q5T750	250 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	C1orf195	Q5TG92	126 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	IGFL1	Q6UW32	110 aa		6.27	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0G2JQZ4	141 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	LST1	O00453	97 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	6.26	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		6.26	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		6.25	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BMG7	143 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BUT2	72 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIAP1	O43715	76 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TEN1	Q86WV5	123 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		6.23	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		6.22	□□□□□ -1.41
TTLL3-231	ENST00000496246		M0R143	59 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246		Q6Q795	121 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		6.21	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246		K7ERJ3	54 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC17	Q685J3	4493 aa		6.2	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	PCOTH	Q58A44	107 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	MUC2	Q02817	5179 aa		6.18	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A087WSZ3	146 aa		6.17	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TRAC	P01848	142 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	SMIM6	P0DI80	62 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	UBE2V1	Q13404	147 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	DSCR8	Q96T75	97 aa		6.15	□□□□□ -1.42
TTLL3-231	ENST00000496246	TSTD3	H0UI37	97 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		6.14	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GV72	72 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246	SIGMAR1	Q99720	223 aa		6.13	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246	CCK	P06307	115 aa		6.12	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	6.12	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246	ATXN8	Q156A1	80 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246		Q96NJ1	140 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246	VPS25	Q9BRG1	176 aa		6.11	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246		Q75L30	129 aa		6.09	□□□□□ -1.43
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PNM2	257 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246		C9JAW5	83 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	IGKV4-1	P06312	121 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		6.07	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00313	P59037	77 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	BATF	Q16520	125 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		6.05	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE6G	P18545	87 aa		6.04	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246		J3KT08	172 aa		6.03	□□□□□ -1.44
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1B0GW54	56 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFB1	O75438	58 aa		6.02	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246	DSCR10	P59022	87 aa		6.01	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		6	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246	C8orf87	E5RJ46	101 aa		6	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		6	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246		M0R2T5	61 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246		A8MUU9	505 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TTLL3-231	ENST00000496246	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		5.96	□□□□□ -1.46

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