RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 LINC00167Q96N53 147 aa4.57□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 PRR4Q16378 134 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 BPY2O14599 106 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 TNXBP22105 4242 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 COX7BP24311 80 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 UBE2BP63146 152 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZVQ6 151 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 A8MUN3 132 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 M0R378 163 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 FAM168BA1KXE4 195 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 A8MU10 97 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 M0R2N4 97 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 RYR1P21817 5038 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZSA8 131 aa4.52□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.52□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 C7orf33Q8WU49 177 aa4.52□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 Q8N9L7 120 aa4.52□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 HSPG2P98160 4391 aa4.52□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 RTL8CO15255 209 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 Q1T7F1 81 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 hDV103S1A0JD37 113 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 NDUFS5O43920 106 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZQT0 140 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 UBE2AP49459 152 aa4.5□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.5□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.5□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 PSCAO43653 123 aa4.5□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 CXCL6P80162 114 aa4.5□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 HCG22E2RYF7 251 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 A6NED7 52 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 C8orf87E5RJ46 101 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 Q8N1X5 172 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 PRR15LQ9BU68 103 aa4.47□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.47□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.47□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 ERC2-IT1O76042 136 aa4.47□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.47□□□□□ -1.69
HERC4-211ENST00000492996 C16orf90A8MZG2 172 aa4.46□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.46□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.46□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 A0A096LNI7 61 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 Q9BRP9 147 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 J3QL48 77 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 PDE6GP18545 87 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 Q6ZRX8 168 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 Q8N377 158 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 CHTF8P0CG12 524 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 H3BQ85 93 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 Q5VV11 94 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.43□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PNN7 141 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 LCA10Q71F78 164 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 OCR1Q9BZK8 76 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 MUC17Q685J3 4493 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 PRLHP81277 87 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 REG3GQ6UW15 175 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 A0A0G2JQZ4 141 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 SMIM29Q86T20 159 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 SPRR1AP35321 89 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 TGP01266 2768 aa4.4□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
HERC4-211ENST00000492996 IGKV4-1P06312 121 aa4.4□□□□□ -1.71
HERC4-211ENST00000492996 LIMD2Q9BT23 127 aa4.4□□□□□ -1.71
HERC4-211ENST00000492996 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
HERC4-211ENST00000492996 C1orf137Q5JT78 98 aa4.39□□□□□ -1.71
HERC4-211ENST00000492996 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.39□□□□□ -1.71
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