RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488774.1

PTPRD-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRD, Length 420 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-212ENST00000488774 PRO1933Q9H354 126 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRD-212ENST00000488774 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1B0GWB2 263 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 A0A0B4J2C4 111 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 S100A12P80511 92 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 Q6ZQY7 126 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 TRIAP1O43715 76 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 CTAG1AP78358 180 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 TAL2Q16559 108 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 COPS9Q8WXC6 57 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 CLEC2BQ92478 149 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 hADV29S1A0JD25 119 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 H3BUT2 72 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 SPINK1P00995 79 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 HSD52Q0P140 79 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 LCE1DQ5T752 114 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 TPRXLQ17RH7 258 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 IGFL1Q6UW32 110 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 RAB37Q96AX2 223 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 SMIM6P0DI80 62 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 C1orf195Q5TG92 126 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1B0GV72 72 aa3.56□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.56□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 C9orf92A6NGG3 77 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 PCP4L1A6NKN8 68 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 VAMP3Q15836 100 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1W2PNM2 257 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 SLC25A20O43772 301 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 CD164Q04900 197 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 H0YGX0 51 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 Q5XG85 94 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 Q96NJ1 140 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRD-212ENST00000488774 LCE4AQ5TA78 99 aa3.52□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 LST1O00453 97 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 TCL1BO95988 128 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 PSMB2P49721 201 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.51□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 FABP2P12104 132 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 A0A1B0GX51 115 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 F8WEM9 126 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 H3BMG7 143 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 TAX1BP3O14907 124 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 BATFQ16520 125 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 PCOTHQ58A44 107 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 Q6JHZ5 121 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 LIMD2Q9BT23 127 aa3.49□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 A0A087WSZ3 146 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 Q6Q795 121 aa3.48□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 TRACP01848 142 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 MTURNQ8N3F0 131 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 SVIPQ8NHG7 77 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.47□□□□□ -1.85
PTPRD-212ENST00000488774 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 TSTD3H0UI37 97 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.46□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 M0R143 59 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 SCGB1C2P0DMR2 95 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 TEN1Q86WV5 123 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.45□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 UBE2V1Q13404 147 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.44□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 C9orf118A6NHY6 69 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 DNAL4O96015 105 aa3.43□□□□□ -1.86
PTPRD-212ENST00000488774 COX6CP09669 75 aa3.43□□□□□ -1.86
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