RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478911.1

SUPT20H-215, Transcript of SPT20 homolog, SAGA complex component, humanhuman

TSL 3

Gene SUPT20H, Length 591 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT20H-215ENST00000478911 C3orf79P0CE67 100 aa-1.09□□□□□ -2.58
SUPT20H-215ENST00000478911 PRO3102Q9H379 93 aa-1.09□□□□□ -2.58
SUPT20H-215ENST00000478911 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-1.09□□□□□ -2.58
SUPT20H-215ENST00000478911 PLIN4Q96Q06 1357 aa-1.09□□□□□ -2.58
SUPT20H-215ENST00000478911 LAMA3Q16787 3333 aa-1.1□□□□□ -2.58
SUPT20H-215ENST00000478911 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-1.1□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP-1.1□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 CUBNO60494 3623 aa-1.1□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 CEBPZOSA8MTT3 80 aa-1.11□□□□□ -2.59
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SUPT20H-215ENST00000478911 LINC00643Q86TS7 51 aa-1.11□□□□□ -2.59
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SUPT20H-215ENST00000478911 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-1.11□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 LYSTQ99698 3801 aa-1.12□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 C9orf92A6NGG3 77 aa-1.12□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 LINC00158P58513 81 aa-1.12□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 RABAC1Q9UI14 185 aa-1.12□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-1.12□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-1.12□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 CCNB3Q8WWL7 1395 aa-1.12□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 NWD1Q149M9 1564 aa-1.13□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 LTN1O94822 1766 aa-1.13□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 DNAH9Q9NYC9 4486 aa-1.13□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 NDUFB1O75438 58 aa-1.13□□□□□ -2.59
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SUPT20H-215ENST00000478911 LRRK2Q5S007 2527 aa-1.13□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 PKD1L2Q7Z442 2459 aa-1.13□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 NBEAQ8NFP9 2946 aa-1.13□□□□□ -2.59
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SUPT20H-215ENST00000478911 PLXNC1O60486 1568 aa-1.14□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 NESP48681 1621 aa-1.15□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 NCOA2Q15596 1464 aa-1.15□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 SCN11AQ9UI33 1791 aa-1.16□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 WIZO95785 1651 aa-1.16□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 ZNF831Q5JPB2 1677 aa-1.16□□□□□ -2.59
SUPT20H-215ENST00000478911 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP-1.16□□□□□ -2.59
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SUPT20H-215ENST00000478911 ACYP1P07311 99 aa-1.17□□□□□ -2.6
SUPT20H-215ENST00000478911 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-1.17□□□□□ -2.6
SUPT20H-215ENST00000478911 ABCC3O15438 1527 aa-1.17□□□□□ -2.6
SUPT20H-215ENST00000478911 CCDC168Q8NDH2 2452 aa-1.17□□□□□ -2.6
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SUPT20H-215ENST00000478911 H0YAA0 97 aa-1.19□□□□□ -2.6
SUPT20H-215ENST00000478911 FAM186AA6NE01 2351 aa-1.19□□□□□ -2.6
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SUPT20H-215ENST00000478911 ITPR1Q14643 2758 aa-1.2□□□□□ -2.6
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SUPT20H-215ENST00000478911 DEPDC5O75140 1603 aa-1.21□□□□□ -2.6
SUPT20H-215ENST00000478911 KIF14Q15058 1648 aa-1.21□□□□□ -2.6
SUPT20H-215ENST00000478911 UMAD1C9J7I0 102 aa-1.21□□□□□ -2.6
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SUPT20H-215ENST00000478911 CEP290O15078 2479 aa-1.21□□□□□ -2.6
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SUPT20H-215ENST00000478911 DIP2BQ9P265 1576 aa-1.21□□□□□ -2.6
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SUPT20H-215ENST00000478911 IFI6P09912 130 aa-1.23□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 TDRG1Q3Y452 100 aa-1.23□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-1.23□□□□□ -2.61
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SUPT20H-215ENST00000478911 DEFB130AP0DP74 79 aa-1.25□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 PIK3C2BO00750 1634 aa-1.26□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 PPLO60437 1756 aa-1.26□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 NDUFA4O00483 81 aa-1.26□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 CCDC88BA6NC98 1476 aa-1.26□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 TRIOO75962 3097 aa-1.27□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 RELNP78509 3460 aa-1.27□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 S4R3F8 94 aa-1.27□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-1.27□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 FRYQ5TBA9 3013 aa-1.27□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 CEP295Q9C0D2 2601 aa-1.28□□□□□ -2.61
SUPT20H-215ENST00000478911 IAPPP10997 89 aa-1.29□□□□□ -2.62
SUPT20H-215ENST00000478911 MT1HP80294 61 aa-1.29□□□□□ -2.62
SUPT20H-215ENST00000478911 NREPQ16612 68 aa-1.29□□□□□ -2.62
SUPT20H-215ENST00000478911 SACSQ9NZJ4 4579 aa-1.29□□□□□ -2.62
SUPT20H-215ENST00000478911 UACAQ9BZF9 1416 aa-1.3□□□□□ -2.62
SUPT20H-215ENST00000478911 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-1.3□□□□□ -2.62
SUPT20H-215ENST00000478911 ACACBO00763 2458 aa-1.31□□□□□ -2.62
SUPT20H-215ENST00000478911 MT1HL1P0DM35 61 aa-1.31□□□□□ -2.62
SUPT20H-215ENST00000478911 ITPR2Q14571 2701 aa-1.31□□□□□ -2.62
SUPT20H-215ENST00000478911 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP-1.31□□□□□ -2.62
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