RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 H0YGX0 51 aa9.22□□□□□ -0.93
ATG4B-216ENST00000475195 FXYD2P54710 66 aa9.22□□□□□ -0.93
ATG4B-216ENST00000475195 Q5XG85 94 aa9.22□□□□□ -0.93
ATG4B-216ENST00000475195 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.22□□□□□ -0.93
ATG4B-216ENST00000475195 H7C2G1 150 aa9.21□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.21□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 LIMD2Q9BT23 127 aa9.21□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 MUC17Q685J3 4493 aa9.21□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 HRCT1Q6UXD1 115 aa9.2□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.19□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 HSD52Q0P140 79 aa9.19□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.19□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 A0A0G2JQZ4 141 aa9.16□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.16□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1B0GX51 115 aa9.15□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 F8WEM9 126 aa9.15□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.15□□□□□ -0.94
ATG4B-216ENST00000475195 SNCGO76070 127 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-216ENST00000475195 Q6JHZ5 121 aa9.14□□□□□ -0.95
ATG4B-216ENST00000475195 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.12□□□□□ -0.95
ATG4B-216ENST00000475195 TRIAP1O43715 76 aa9.11□□□□□ -0.95
ATG4B-216ENST00000475195 C1orf195Q5TG92 126 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-216ENST00000475195 IGFL1Q6UW32 110 aa9.1□□□□□ -0.95
ATG4B-216ENST00000475195 CLEC2BQ92478 149 aa9.09□□□□□ -0.95
ATG4B-216ENST00000475195 K7ERJ3 54 aa9.07□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 GHRHP01286 108 aa9.07□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.07□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 XP32Q5T750 250 aa9.07□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 TCL1BO95988 128 aa9.06□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.05□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 COX6CP09669 75 aa9.03□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 SMIM6P0DI80 62 aa9.03□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 Q6Q795 121 aa9.03□□□□□ -0.96
ATG4B-216ENST00000475195 H3BUT2 72 aa9.02□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 PSMB2P49721 201 aa9.02□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 H3BQ85 93 aa9□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 H3BMG7 143 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 FABP2P12104 132 aa8.98□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 A0A0U1RQV1 116 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 DNAL4O96015 105 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 TEN1Q86WV5 123 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.97□□□□□ -0.97
ATG4B-216ENST00000475195 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 C9orf92A6NGG3 77 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.96□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 TRACP01848 142 aa8.95□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 M0R143 59 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.94□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 LST1O00453 97 aa8.93□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 UBE2V1Q13404 147 aa8.92□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1W2PNM2 257 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.9□□□□□ -0.98
ATG4B-216ENST00000475195 TSTD3H0UI37 97 aa8.88□□□□□ -0.99
ATG4B-216ENST00000475195 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.88□□□□□ -0.99
ATG4B-216ENST00000475195 A0A087WSZ3 146 aa8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-216ENST00000475195 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-216ENST00000475195 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
ATG4B-216ENST00000475195 PCOTHQ58A44 107 aa8.85□□□□□ -0.99
ATG4B-216ENST00000475195 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
ATG4B-216ENST00000475195 Q96NJ1 140 aa8.84□□□□□ -0.99
ATG4B-216ENST00000475195 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.83□□□□□ -1
ATG4B-216ENST00000475195 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
ATG4B-216ENST00000475195 ATXN8Q156A1 80 aa8.8□□□□□ -1
ATG4B-216ENST00000475195 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
ATG4B-216ENST00000475195 CCKP06307 115 aa8.79□□□□□ -1
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1B0GV72 72 aa8.78□□□□□ -1
ATG4B-216ENST00000475195 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.77□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 Q75L30 129 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 DSCR8Q96T75 97 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.75□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 BATFQ16520 125 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.73□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 C9JAW5 83 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.72□□□□□ -1.01
ATG4B-216ENST00000475195 C9orf118A6NHY6 69 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 LCE2CQ5TA81 110 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.71□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 TAX1BP3O14907 124 aa8.7□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 A8MUU9 505 aa8.69□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 IGKV4-1P06312 121 aa8.69□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.68□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1B0GW54 56 aa8.68□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 Q6ZQT0 140 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 VPS25Q9BRG1 176 aa8.67□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1W2PPM0 123 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 PDE6GP18545 87 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 SIGMAR1Q99720 223 aa8.66□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 DSCR10P59022 87 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 LINC00313P59037 77 aa8.65□□□□□ -1.02
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.63□□□□□ -1.03
ATG4B-216ENST00000475195 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms