RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468641.1

PTPRZ1-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRZ1, Length 554 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PTPRZ1-203ENST00000468641 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.65□□□□□ -2.51
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