RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.91	□□□□□ -1.62
IL6-208	ENST00000464710	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710		F8WEM9	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710		Q8NBF4	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	C9orf118	A6NHY6	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	TAX1BP3	O14907	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.89	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	ATXN8	Q156A1	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.88	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710		H3BQ85	93 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	LST1	O00453	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	TCL1B	O95988	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	TRAC	P01848	142 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.86	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710		A0A1W2PPM0	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710		H3BMG7	143 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GV72	72 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	SPINK1	P00995	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IL6-208	ENST00000464710	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.84	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710		C9JAW5	83 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710		Q6JHZ5	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	PRR4	Q16378	134 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.81	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.8	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	CD164	Q04900	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.78	□□□□□ -1.64
IL6-208	ENST00000464710	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.77	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710		K7EP34	96 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.76	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710		H3BT86	120 aa		4.75	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	TNXB	P22105	4242 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710		A0A1W2PNM2	257 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	CCK	P06307	115 aa		4.74	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710		A0A087WSZ3	146 aa		4.73	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710		Q6Q795	121 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.72	□□□□□ -1.65
IL6-208	ENST00000464710	PDE6G	P18545	87 aa		4.71	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.71	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710		Q5XG85	94 aa		4.71	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.71	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710		F8W1H4	67 aa		4.7	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GV90	55 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710		Q6ZQT0	140 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.69	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.68	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.68	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.67	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	HERC1	Q15751	4861 aa		4.66	□□□□□ -1.66
IL6-208	ENST00000464710	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	NREP	Q16612	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.65	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710		A0A1B0GW54	56 aa		4.64	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710		Q96NJ1	140 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.62	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710		J3KT08	172 aa		4.6	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	NDUFB1	O75438	58 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	LINC00313	P59037	77 aa		4.59	□□□□□ -1.67
IL6-208	ENST00000464710	DSCR10	P59022	87 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IL6-208	ENST00000464710	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.58	□□□□□ -1.68
IL6-208	ENST00000464710	BPY2	O14599	106 aa		4.57	□□□□□ -1.68
IL6-208	ENST00000464710	XP32	Q5T750	250 aa		4.57	□□□□□ -1.68

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