RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462351.5

PTPRN-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 5,099 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-211ENST00000462351 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP9.3□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 C19orf73Q9NVV2 129 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 NBEAQ8NFP9 2946 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 C9orf92A6NGG3 77 aa9.28□□□□□ -0.92
PTPRN-211ENST00000462351 HECTD1Q9ULT8 2610 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRN-211ENST00000462351 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.27□□□□□ -0.93
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP10-11P60412 298 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRN-211ENST00000462351 CSAG1Q6PB30 78 aa9.26□□□□□ -0.93
PTPRN-211ENST00000462351 SPRR4Q96PI1 79 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRN-211ENST00000462351 CR1P17927 2039 aa9.26□□□□□ -0.93
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PTPRN-211ENST00000462351 LINC00612Q8N6U2 182 aa9.21□□□□□ -0.94
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PTPRN-211ENST00000462351 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRN-211ENST00000462351 J3QL48 77 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRN-211ENST00000462351 OXTP01178 125 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRN-211ENST00000462351 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.06□□□□□ -0.96
PTPRN-211ENST00000462351 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.06□□□□□ -0.96
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PTPRN-211ENST00000462351 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRN-211ENST00000462351 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRN-211ENST00000462351 CASC10Q5T4H9 136 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRN-211ENST00000462351 DMDP11532 3685 aa8.9□□□□□ -0.98
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PTPRN-211ENST00000462351 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.88□□□□□ -0.99
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PTPRN-211ENST00000462351 SPRR1BP22528 89 aa8.83□□□□□ -1
PTPRN-211ENST00000462351 S4R3F8 94 aa8.83□□□□□ -1
PTPRN-211ENST00000462351 Q8NDZ9 215 aa8.82□□□□□ -1
PTPRN-211ENST00000462351 COL12A1Q99715 3063 aa8.81□□□□□ -1
PTPRN-211ENST00000462351 FLNCQ14315 2725 aa8.81□□□□□ -1
PTPRN-211ENST00000462351 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.81□□□□□ -1
PTPRN-211ENST00000462351 MUC3AQ02505 3323 aa8.81□□□□□ -1
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PTPRN-211ENST00000462351 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.79□□□□□ -1
PTPRN-211ENST00000462351 CHD6Q8TD26 2715 aa8.78□□□□□ -1
PTPRN-211ENST00000462351 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.78□□□□□ -1
PTPRN-211ENST00000462351 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRN-211ENST00000462351 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRN-211ENST00000462351 NOTCH1P46531 2555 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRN-211ENST00000462351 A6NN06 94 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRN-211ENST00000462351 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRN-211ENST00000462351 Q6ZR54 194 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRN-211ENST00000462351 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.71□□□□□ -1.02
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRN-211ENST00000462351 LAMA5O15230 3695 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRN-211ENST00000462351 ITPR1Q14643 2758 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRN-211ENST00000462351 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRN-211ENST00000462351 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
PTPRN-211ENST00000462351 M0R2T5 61 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRN-211ENST00000462351 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRN-211ENST00000462351 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRN-211ENST00000462351 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRN-211ENST00000462351 NDUFAF8A1L188 74 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRN-211ENST00000462351 M0QZ58 72 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRN-211ENST00000462351 RELNP78509 3460 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRN-211ENST00000462351 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
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