RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZVH6 145 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM11BQ8TCY0 68 aa3.97□□□□□ -1.77
RABGEF1-206ENST00000461017 A6NDN8 102 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 COX8AP10176 69 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SPRR1BP22528 89 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 AKR1D1P51857 326 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 C14orf144Q96I85 54 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.96□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0G2JQZ4 141 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 CD164Q04900 197 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM29Q86T20 159 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 Q8N377 158 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.95□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 C12orf57Q99622 126 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 MUC2Q02817 5179 aa3.94□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GV90 55 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GWB2 263 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 DLEU1O43261 78 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SPINK1P00995 79 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 Q1RN00 199 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SPATA45Q537H7 98 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.93□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 CFC1BP0CG36 223 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 CFC1P0CG37 223 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 TPRXLQ17RH7 258 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 PYY3Q5JQD4 70 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 COPS9Q8WXC6 57 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 HIST1H4GQ99525 98 aa3.92□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 LINC00575Q6W349 94 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 SIGMAR1Q99720 223 aa3.91□□□□□ -1.78
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 HIGD1BQ9P298 99 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.9□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 H7C2G1 150 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 C4orf26Q17RF5 130 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZVQ6 151 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 VAMP8Q9BV40 100 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 PRO0628Q9UI54 55 aa3.89□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 FXYD2P54710 66 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 CEND1Q8N111 149 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.88□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 hADV29S1A0JD25 119 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC25A20O43772 301 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 SMIM6P0DI80 62 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6ZQY7 126 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0B4J2C4 111 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 PRO1933Q9H354 126 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 C1orf195Q5TG92 126 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 VPS25Q9BRG1 176 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 IGFL1Q6UW32 110 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB37Q96AX2 223 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGEF1-206ENST00000461017 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 C9orf92A6NGG3 77 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 K7ERJ3 54 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 OCIAD2Q56VL3 154 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 Q5XG85 94 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 LIMD2Q9BT23 127 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.82□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 H3BUT2 72 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 HSD52Q0P140 79 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 CLEC2BQ92478 149 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.81□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 H0YGX0 51 aa3.8□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 UQCR10Q9UDW1 63 aa3.79□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 F8WEM9 126 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 Q6JHZ5 121 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 PPDPFLQ8WWR9 84 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.78□□□□□ -1.8
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A0U1RQV1 116 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 PCOTHQ58A44 107 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 MPLKIPQ8TAP9 179 aa3.77□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1B0GX51 115 aa3.76□□□□□ -1.81
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A1W2PNM2 257 aa3.76□□□□□ -1.81
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