RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453030.5

GARNL3-210, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 536 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-210ENST00000453030 FXYD2P54710 66 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 MT1HP80294 61 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 TAL2Q16559 108 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 A4D1N5 150 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 M0R143 59 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 IFITM1P13164 125 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZVH6 145 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-210ENST00000453030 SPRR1BP22528 89 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 K7ERJ3 54 aa6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 CFC1BP0CG36 223 aa6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 Q1RN00 199 aa6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 COPS9Q8WXC6 57 aa6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 H7C2G1 150 aa6.31□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 RAB37Q96AX2 223 aa6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 A6NDN8 102 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 CFC1P0CG37 223 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 COX7BP24311 80 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 C6orf99Q4VX62 202 aa6.29□□□□□ -1.4
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 M0R2T5 61 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 CD164Q04900 197 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 A0A0B4J2C4 111 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 A0A0G2JQZ4 141 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GWB2 263 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 C1orf195Q5TG92 126 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 TAX1BP3O14907 124 aa6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM29Q86T20 159 aa6.23□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 Q5XG85 94 aa6.22□□□□□ -1.41
GARNL3-210ENST00000453030 H3BUT2 72 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 PSMB2P49721 201 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 C9orf118A6NHY6 69 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 TRIAP1O43715 76 aa6.17□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.17□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 TCL1BO95988 128 aa6.16□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GV90 55 aa6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1W2PPM0 123 aa6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-210ENST00000453030 F8WEM9 126 aa6.14□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 CLEC2BQ92478 149 aa6.14□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 COX6CP09669 75 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 FABP2P12104 132 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 VAMP3Q15836 100 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 Q6Q795 121 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.11□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.11□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.1□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.1□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 USH2AO75445 5202 aa6.09□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 H0YGX0 51 aa6.09□□□□□ -1.43
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 K7EP34 96 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 ATXN8Q156A1 80 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 Q6ZQY7 126 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 SSPOA2VEC9 5147 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 IGFL1Q6UW32 110 aa6.07□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 LINC00575Q6W349 94 aa6.07□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.07□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.06□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 H3BMG7 143 aa6.06□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 LST1O00453 97 aa6.06□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 Q6JHZ5 121 aa6.06□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.06□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 Q75L30 129 aa6.06□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 MTURNQ8N3F0 131 aa6.06□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 hADV29S1A0JD25 119 aa6.05□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 C9JAW5 83 aa6.03□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 SNCGO76070 127 aa6.03□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 DNAL4O96015 105 aa6.03□□□□□ -1.44
GARNL3-210ENST00000453030 TRACP01848 142 aa6.02□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 UBE2V1Q13404 147 aa6.02□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.02□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 Q96NJ1 140 aa6.02□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GX51 115 aa6.01□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.99□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.99□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.98□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 PRO0461Q9UI25 63 aa5.98□□□□□ -1.45
GARNL3-210ENST00000453030 A0A1B0GV72 72 aa5.97□□□□□ -1.45
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