RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439418.1

C9orf135-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene C9orf135-AS1, Length 1,375 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa3.44□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.44□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 NDUFAF8A1L188 74 aa3.43□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGLV7-43P04211 117 aa3.43□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FXYD4P59646 89 aa3.43□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLKP1Q107X0 134 aa3.43□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 HIGD2BQ4VC39 106 aa3.43□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.43□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.43□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.43□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PPYP01298 95 aa3.42□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP10-8P60410 259 aa3.42□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM168BA1KXE4 195 aa3.41□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERHP84090 104 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MANBALQ9NQG1 85 aa3.41□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-30P01768 117 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-33P01772 117 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.4□□□□□ -1.86
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A096LNJ9 63 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COX8AP10176 69 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBE2D3P61077 147 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UBE2D2P62837 147 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF56Q15929 161 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 DEFB116Q30KQ4 102 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MUC17Q685J3 4493 aa3.39□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1B0GU33 70 aa3.38□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ERC2-IT1O76042 136 aa3.38□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TVP23CQ96ET8 276 aa3.38□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.38□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRO0255Q9UI72 69 aa3.38□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa3.37□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.37□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LIMD2Q9BT23 127 aa3.37□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C22orf24Q9Y442 160 aa3.37□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.37□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa3.36□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa3.36□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.36□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPINK4O60575 86 aa3.36□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MOBPQ13875 183 aa3.36□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 V9GYH0 126 aa3.36□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 COX6CP09669 75 aa3.35□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 P0C880 135 aa3.35□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C3orf79P0CE67 100 aa3.35□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C14orf177Q52M58 125 aa3.35□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q8TAT8 98 aa3.35□□□□□ -1.87
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.34□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SNRPGP15A8MWD9 76 aa3.34□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 Q5VV11 94 aa3.34□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C2orf82Q6UX34 121 aa3.34□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.34□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.33□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.33□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.33□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TXNDC17Q9BRA2 123 aa3.33□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.32□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.32□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.32□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.32□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 IFI27L1Q96BM0 104 aa3.32□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.31□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.31□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GCHFRP30047 84 aa3.31□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C20orf197Q8N268 126 aa3.31□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KLK12Q9UKR0 248 aa3.31□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 F8WEM9 126 aa3.3□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.3□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 LINC00483Q53H64 154 aa3.3□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PRR9Q5T870 116 aa3.3□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF815PA8K554 130 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CEBPZOSA8MTT3 80 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 H3BRN7 92 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 ZNF861PO60384 105 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 PYDC2Q56P42 97 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.29□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa3.28□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.28□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 A0A1W2PNM2 257 aa3.28□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SFTA2Q6UW10 78 aa3.28□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAGE3Q86Y29 109 aa3.28□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 BAGE2Q86Y30 109 aa3.28□□□□□ -1.88
C9orf135-AS1-201ENST00000439418 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms